1 - 51
UN11666 --> GGGTGAGACCCCCTTTAAACAAAATCGGATTTCTATCTATAAAACCGATC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ..................................................
FD560450 --> GGGTGAGACCCCCTTTAAACAAAATCGGATTTCTATCTATAAAACCGATC
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> ..................................................
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> ..................................................
51 - 101
UN11666 --> TTATCTCTCAATCCGCCTCCGGAAACTCAAACATCATCATCATCTGAGAT
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ..................................................
FD560450 --> TTATCTCTCAATCCGCCTCCTCAAACTCAAACATCATCATCATCTGAGAT
EW715996 --> ....................GGAAACTCAAACATCATCATCATCTGAGAT
EY931272 --> ....................GGAAACTCAAACATCATCATCATCTGAGAT
FD552121 --> ....................GGAAACTCAAACATCATCATC---TGAGAT
FD556130 --> ..................................................
101 - 151
UN11666 --> TGATTGATTGAAAGAG-GAGAGAGAGAGAGAAATGGAGAACAATACTAAG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ..................................................
FD560450 --> TGATTGATTGAAAG-G-GAGAGAGAG-G-GAAATGGAGAACAATACTAAG
EW715996 --> TGATTGATTGAAAG-G-GAGAGAGAGAGA--AATGGAGAACAATACTAAG
EY931272 --> TGATTGATTGAAAG-G-GAGAGAGAGAGA--AATGGAGAACAATACTAAG
FD552121 --> TGATTGATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGGAGAACAATACTAAG
FD556130 --> ......ggattgattggaAGAGAGAGAGAGAAATGGAGAACAATACTAAG
151 - 201
UN11666 --> AGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGCTAGAGAAAGTAGGAGA
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ..................................................
FD560450 --> AGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGCTAGAGAAAGTAGGAGA
EW715996 --> AGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGCTAGAGAAAGTAGGAGA
EY931272 --> AGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGCTAGAGAAAGTAGGAGA
FD552121 --> AGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGCTAGAGAAAGTAGGAGA
FD556130 --> AGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGCTAGAGAAAGTAGGAGA
201 - 251
UN11666 --> AGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTGGTCTCA
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ..................................................
FD560450 --> AGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTGGTCTCA
EW715996 --> AGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTGGTCTCA
EY931272 --> AGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTGGTCTCA
FD552121 --> AGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTGGTCTCA
FD556130 --> AGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTGGTCTCA
251 - 301
UN11666 --> TCGTCGCTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCT
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ..................................................
FD560450 --> TCGTCGCTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCT
EW715996 --> TCGTCGCTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCT
EY931272 --> TCGTCGCTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCT
FD552121 --> TCGTCGCTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCT
FD556130 --> TCGTCGCTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCT
301 - 351
UN11666 --> CCCACCACTCTCCGCGAGATCTCCATCCTCCGCATGCTCGCTCGCGATCC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ..................................................
FD560450 --> CCCACCACTCTCCGCGAGATCTCCATCCTCCGCATGCTCGCTCGCGATCC
EW715996 --> CCCACCACTCTCCGCGAGATCTCCATCCTCCGCATGCTCGCTCGCGATCC
EY931272 --> CCCACCACTCTCCGCGAGATCTCCATCCTCCGCATGCTCGCTCGCGATCC
FD552121 --> CCCACCACTCTCCGCGAGATCTCCATCCTCCGCATGCTCGCTCGCGATCC
FD556130 --> CCCACCACTCTCCGCGAGATCTCCATCCTCCGCATGCTTGCTCGCGATCC
351 - 401
UN11666 --> CCACATCGTCAGGTTGATGGATGTTAAGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCA
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ..........................................AGAAGGCA
FD560450 --> CCACATCGTCAGGTTGATGGATGTTAAGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCA
EW715996 --> CCACATCGTCAGGTTGATGGATGTTAAGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCA
EY931272 --> CCACATCGTCAGGTTGATGGATGTTAAGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCA
FD552121 --> CCACATCGTCAGGTTGATGGATGTTAAGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCA
FD556130 --> CCACATCGTCAGATTGATGGATGTTAAGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCA
401 - 451
UN11666 --> AGACTGTGCTCTACCTTGTGTTCGAGTACGTTGACACTGATCTCAAGAAG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- AGACTGTGCTCTACCTCGTGTTCGAGTACGTTGACACTGATCTCAAGAAG Raphanus raphanistrum subsp. landra
FD560450 --> AGACTGTGCTCTACCTTGTGTTCGAGTACGTTGACACGGATCTCAAGAAG Raphanus sativus var. oleiformis
EW715996 --> AGACTGTGCTCTACCTTGTGTTCGAGTACGTTGACACGGATCTCAAGAAG Raphanus sativus var. oleiformis
EY931272 --> AGACTGTGCTCTACCTTGTGTTCGAGTACGTTGACACGGATCTCAAGAAG Raphanus sativus var. oleiformis
FD552121 --> AGACTGTGCTCTACCT-GTCTTCGAGTACGTTGACACTGATCTCAAGAAG Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD556130 --> AGACTGTGCTCTACCTCGTGTTCGAGTACGTTGACACTGATCTCAAGAAG Raphanus raphanistrum subsp. landra
451 - 501
UN11666 --> TTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCAGAACACTGT
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- TTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCAGATCACTGT Raphanus raphanistrum subsp. landra
FD560450 --> TTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCACAACACTGT Raphanus sativus var. oleiformis
EW715996 --> TTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCACAACACTGT Raphanus sativus var. oleiformis
EY931272 --> TTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCACAACACTGT Raphanus sativus var. oleiformis
FD552121 --> TTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAACCATTCCCCAGAACACTGT Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD556130 --> TTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCAGATCACTGT Raphanus raphanistrum subsp. landra
501 - 551
UN11666 --> CAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCATGGCC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- CAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCATGGCC Raphanus raphanistrum subsp. landra
FD560450 --> CAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCACGGCC Raphanus sativus var. oleiformis
EW715996 --> CAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCACGGCC Raphanus sativus var. oleiformis
EY931272 --> CAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCACGGCC Raphanus sativus var. oleiformis
FD552121 --> CAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCATGGCC Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD556130 --> CAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCATGGCC Raphanus raphanistrum subsp. landra
551 - 601
UN11666 --> ATGGAGTGTTGCACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGT
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ATGGAGTGTTACACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGT Raphanus raphanistrum subsp. landra
FD560450 --> ATGGAGTGTTGCACAGGGATCTTAAGCCACACAATCTCTTGATGGACCGT Raphanus sativus var. oleiformis
EW715996 --> ATGGAGTGTTGCACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGT Raphanus sativus var. oleiformis
EY931272 --> ATGGAGTGTTGCACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGT Raphanus sativus var. oleiformis
FD552121 --> ATGGAGTGTTACACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGT Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD556130 --> ATGGAGTGTTACACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGT Raphanus raphanistrum subsp. landra
601 - 651
UN11666 --> CAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCAC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- CAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCAC
FD560450 --> CAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCAC
EW715996 --> CAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCAC
EY931272 --> CAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCAC
FD552121 --> CAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCAC
FD556130 --> CAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCAC
651 - 701
UN11666 --> TCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- TCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAG
FD560450 --> TCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAG
EW715996 --> TCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAG
EY931272 --> TCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAG
FD552121 --> TCTCCCCATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAG
FD556130 --> TCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAG
701 - 751
UN11666 --> CTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAGCCCATTACTCAACCGCTGTTGATATG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- CTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAGCCCATTACTCAACCGCTGTTGATATG
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> CTCC..............................................
EY931272 --> CTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAACCCATTACTCAACCGCTGTTGATATG
FD552121 --> CTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAACCCATTACTCAACCGCTGTTGATATG
FD556130 --> CTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAGCCCATTACTCAACCGCTGTTGATATG
751 - 801
UN11666 --> TGGTCTGTTGGCTGCATTTTTGCTGAACTTGTGAACAAGCAAGCAATCTT
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- TGGTCTGTTGGCTGCATTTTTGCTGAACTTGTGAACAAGCAAGCAATCTT
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> TGGTCTGTTGGCTGCATTTT-GCTGA-CTTGTGA-CAAGCAAGCAAT-TT
FD552121 --> TGGTCTGTTGGCTGCATTTTTGCTGAACTTGTGAcagca...........
FD556130 --> TGGTCTGTTGGCTGCATTTTTGCTGAACTTGTGAACAAGCAAGCAATCTT
801 - 851
UN11666 --> TGCTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGCTCCTCAGTATTTTCAGGTTGCTAG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- TGCTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGCTCCTCAGTATTTTCAGGTTGCTAG
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> TGCTGGAGACTCTGAGCTCCA-CA-CTCCTCAGTATTT............
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> TGCTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGCTCCTCAGTATTTTCAG-TTGCTAG
851 - 901
UN11666 --> GAACACCAAACGAACAAGTGTGGCCTGGAGTGAGCAAACTCAAGACTGGC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- GAACACCAAACGAACAAGTGTGGCCTGGAGTGAGCAAACTCAAGACTGGC
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> ..................................................
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> GA-CACCAAACGA.....................................
901 - 951
UN11666 --> ATGAATACCCACAGTGGAAACCTTTGAGCCTCTCAACAGCTGTTCCAAAC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ATGAATACCCACAGTGGAAACCTTTGAGCCTCTCAACAGCTGTTCCAAAC
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> ..................................................
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> ..................................................
951 - 1001
UN11666 --> CTCGATGAGTCCGGACTTGATCTCTTATCAAAAATGCTGGAGTATGAGCC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- CTCGATGAGTCCGGACTTGATCTCTTATCAAAAATGCTGGAGTATGAGCC
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> ..................................................
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> ..................................................
1001 - 1051
UN11666 --> AGTGAAACGAATCTCAGCTAAGAAGGCTATGGAGCATCCTTACTTCGATG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- AGTGAAACGAATCTCAGCTAAGAAGGCTATGGAGCATCCTTACTTCGATG
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> ..................................................
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> ..................................................
1051 - 1101
UN11666 --> ATCTACCTGACAAATCCCTTCTCTGAAGATCTCTTTATGAACGAACTCTC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- ATCTACCTGACAAATCCCTTCTCTGAAGATCTCTTTATGAACGAACTCTC
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> ..................................................
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> ..................................................
1101 - 1151
UN11666 --> TCTCTGTAGTCTTGTTTGTTCCAACTTTGTCATTGCTTGTCTCAAGCACC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- TCTCTGTAGTCTTGTTTGTTCCAACTTTGTCATTGCTTGTCTCAAGCACC
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> ..................................................
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> ..................................................
1151 - 1201
UN11666 --> TTATCTTGCTCTCTTAGTAGGATGATCAACCTTTTCAAATGGGGTCTATG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- TTATCTTGCTCTCTTAGTAGGATGATCAACCTTTTCAAATGGGGTCTATG
FD560450 --> ..................................................
EW715996 --> ..................................................
EY931272 --> ..................................................
FD552121 --> ..................................................
FD556130 --> ..................................................
1201 - 1251
UN11666 --> TTCCCAGTCGTATAAACCTCAACTTCGTT
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD552483 <-- TTCCCAGTCGTATAAACCTCAACTTCGTT
FD560450 --> .............................
EW715996 --> .............................
EY931272 --> .............................
FD552121 --> .............................
FD556130 --> .............................
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