Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Alignment for radish unigene UN13690

               1      -     51
UN13690        --> GGAATATCTCGGATTCTCTCAACCCATCTCTATCGCTTCTTCCCCCTATA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- GGAATATCTCGGATTCTCTCAACCCATCTCTATCGCTTCTTCCCCCTATA
EW719413       <-- .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
EY903707       <-- .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
EY912370       <-- .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
FD530895       <-- .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
FD960618       <-- ..................................................
EY909620       <-- ..................................................
FD959559       <-- ..................................................
FD582217       <-- ..................................................
FD579320       --> GGAATATCTCGGATTCTCTCAACCCATCTCTATCGCTTCTTCCCCCTATA
FD964684       --> GGAATATCTCGGATTCTCTCAACCCATCTCTATCGCTTCTTCCCCCTATA
EV526172       --> ...ggATCTCAGATTCTCTCAACCCATCTCTATCGCTTCTTCCCCCTATA
EY948840       --> ........ggaGATTCTCTCAACCCATCTCTATCGCTTCTTCCCCCTATA
EW715719       --> .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
EY907881       --> .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
EY913375       --> .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
EY916738       --> .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
FD535172       --> .............................ggATCGCTTCTTCCCCCTATA
FD963183       --> ..................................................
FD578012       --> ..................................................

               51     -    101
UN13690        --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAACAATGAGTCAG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGGAAA-CCTAACAACAATGAGTCAG
EW719413       <-- ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAAC---AATGAGTCAG
EY903707       <-- ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAAC---AATGAGTCAG
EY912370       <-- ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAAC---AATGAGTCAG
FD530895       <-- ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGGAAA-CCTAACAACAATGAGTCAG
FD960618       <-- ...................TCCATCGGAAA-CCTAACAACAATGAGTCAG
EY909620       <-- .....................CATCGCAAAACCTAACAACAATGAGTCAG
FD959559       <-- .................................TAACAACAATGAGTCAG
FD582217       <-- ..................................................
FD579320       --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGGAAA-CCTAACAACAATGAGTCAG
FD964684       --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGGAAA-CCTAACAACAATGAGTCAG
EV526172       --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA---TGAGTCAG
EY948840       --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA---TGAGTCAG
EW715719       --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA---TGAGTCAG
EY907881       --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA---TGAGTCAG
EY913375       --> ACCTCCT-TCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAACAATGAGTCAG
EY916738       --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA---TGAGTCAG
FD535172       --> ACCTTCTCTCGATCTACTCTCCATCGGAAA-CCTAACAACAATGAGTCAG
FD963183       --> .................................TAACAACAATGAGTCAG
FD578012       --> ..................................................

               101    -    151
UN13690        --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
EW719413       <-- TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
EY903707       <-- TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCGAGGCTATCCACCGGA
EY912370       <-- TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
FD530895       <-- TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGA
FD960618       <-- TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGA
EY909620       <-- TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
FD959559       <-- TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGA
FD582217       <-- ..................................................
FD579320       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
FD964684       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGA
EV526172       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
EY948840       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
EW715719       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
EY907881       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCGAGGCTATCCACCGGA
EY913375       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
EY916738       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGA
FD535172       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGA
FD963183       --> TACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGA
FD578012       --> ..................................................

               151    -    201
UN13690        --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EW719413       <-- GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EY903707       <-- GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EY912370       <-- GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
FD530895       <-- GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
FD960618       <-- GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EY909620       <-- GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
FD959559       <-- GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
FD582217       <-- ..................................................
FD579320       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
FD964684       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EV526172       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EY948840       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EW715719       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EY907881       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EY913375       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
EY916738       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
FD535172       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
FD963183       --> GGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGT
FD578012       --> ..................................................

               201    -    251
UN13690        --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTACCCT
EW719413       <-- ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
EY903707       <-- ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
EY912370       <-- ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
FD530895       <-- ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTACCCT
FD960618       <-- ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTACCCT
EY909620       <-- ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
FD959559       <-- ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTACCCT
FD582217       <-- ..................................................
FD579320       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTACCCT
FD964684       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTACCCT
EV526172       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
EY948840       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
EW715719       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
EY907881       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
EY913375       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
EY916738       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCT
FD535172       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTACCCT
FD963183       --> ATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTACCCT
FD578012       --> ..................................................

               251    -    301
UN13690        --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- CCTCCTTACGCCCCGTAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
EW719413       <-- CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACA  Raphanus sativus var. oleiformis
EY903707       <-- CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCGCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY912370       <-- CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD530895       <-- CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD960618       <-- CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EY909620       <-- CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD959559       <-- CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD582217       <-- .......ggGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
FD579320       --> CCTCCTTACGCCCCGTAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
FD964684       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EV526172       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EY948840       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACA  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
EW715719       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACA  Raphanus sativus var. oleiformis
EY907881       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCGCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY913375       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY916738       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD535172       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD963183       --> CCTCCTTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD578012       --> .......ggGCCCCGCAGTATCCTCCTCCCCCTCAGCATCAGCAGCAGCA  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870

               301    -    351
UN13690        --> GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTTTCTGCTGTTGCT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
EW719413       <-- GAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus sativus var. oleiformis
EY903707       <-- GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY912370       <-- GAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD530895       <-- GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD960618       <-- GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EY909620       <-- GAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD959559       <-- GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD582217       <-- GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTTTCTGCTGTTGCT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
FD579320       --> GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
FD964684       --> GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EV526172       --> GAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EY948840       --> GAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
EW715719       --> GAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus sativus var. oleiformis
EY907881       --> GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY913375       --> GAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY916738       --> GAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD535172       --> GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD963183       --> GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD578012       --> GAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870

               351    -    401
UN13690        --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- GTTTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EW719413       <-- GTCTCTTGGATACTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EY903707       <-- GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EY912370       <-- GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD530895       <-- GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD960618       <-- GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EY909620       <-- GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD959559       <-- GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD582217       <-- GTTTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD579320       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD964684       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EV526172       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EY948840       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EW715719       --> GTCTCTTGGATACTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EY907881       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EY913375       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
EY916738       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD535172       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD963183       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG
FD578012       --> GTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTTTGGAGCCG

               401    -    451
UN13690        --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EW719413       <-- GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EY903707       <-- GTGATTTGATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EY912370       <-- GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD530895       <-- GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD960618       <-- GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EY909620       <-- GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD959559       <-- GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD582217       <-- GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD579320       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD964684       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EV526172       --> GTGATTTGATTGCAA--GAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EY948840       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EW715719       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EY907881       --> GTGATTTGATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EY913375       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
EY916738       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD535172       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD963183       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA
FD578012       --> GTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCA

               451    -    501
UN13690        --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
EW719413       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
EY903707       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTTTATTC-TCTT--TCTGG
EY912370       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD530895       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD960618       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
EY909620       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD959559       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD582217       <-- TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD579320       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD964684       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCC...........
EV526172       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTTTATTC-TCTTT--CTGG
EY948840       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
EW715719       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
EY907881       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTTTATTC-TCTTT--CTGG
EY913375       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
EY916738       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD535172       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD963183       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG
FD578012       --> TTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGG

               501    -    551
UN13690        --> TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
EW719413       <-- TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus sativus var. oleiformis
EY903707       <-- TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY912370       <-- TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD530895       <-- TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD960618       <-- TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EY909620       <-- TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD959559       <-- TTTATGTTCTTAGTTTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD582217       <-- TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
FD579320       --> TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
FD964684       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EV526172       --> TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EY948840       --> TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
EW715719       --> TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus sativus var. oleiformis
EY907881       --> TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY913375       --> TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY916738       --> TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD535172       --> TTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD963183       --> TTTATGTTCTTAGTTTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD578012       --> TTTATGTTCTTGAATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870

               551    -    601
UN13690        --> TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- TGAGACGTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
EW719413       <-- TGAGACGTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGG................  Raphanus sativus var. oleiformis
EY903707       <-- TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTTCTTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY912370       <-- TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACT.........  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD530895       <-- TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD960618       <-- TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EY909620       <-- TGAGACGTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACg.........  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD959559       <-- TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD582217       <-- TGAGACGTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
FD579320       --> TGAGACGTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
FD964684       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EV526172       --> TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCccc  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EY948840       --> TGAGACGTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870
EW715719       --> TGAGACGTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGG................  Raphanus sativus var. oleiformis
EY907881       --> TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTTCTTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY913375       --> TGAGACGTTAAAATGGGAATGT............................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY916738       --> TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACT.........  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD535172       --> TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD963183       --> TGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD578012       --> TGAGACGTTAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTCCTTT  Raphanus sativus cv Rat-Tail Radish #3870

               601    -    651
UN13690        --> ACCTCTCAGTCTTATGTGTTTTTGATAATTCATATCTCAATGATTCGGTT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD583324       <-- ACCTCTCAGTCTTATG..................................
EW719413       <-- ..................................................
EY903707       <-- ACCTCTCAGTC.......................................
EY912370       <-- ..................................................
FD530895       <-- ACCTCTCAGTCTTATGTGTTTTT...........................
FD960618       <-- ACCTCTCAGTCTTATGTGTTTTTGATAATTCATATCTCAATGATTCGGTT
EY909620       <-- ..................................................
FD959559       <-- ACCTCTC...........................................
FD582217       <-- ACCTCTC...........................................
FD579320       --> ACCTCTCAGTCTTATGTGTTTTTGATAATTCAaaaaaaa...........
FD964684       --> ..................................................
EV526172       --> ..................................................
EY948840       --> ACCTCTCAGTCTTATGTGTTTTT...........................
EW715719       --> ..................................................
EY907881       --> ACCTCTCAGTC.......................................
EY913375       --> ..................................................
EY916738       --> ..................................................
FD535172       --> ACCTCTCAGTCTTATG..................................
FD963183       --> ACCTCTC...........................................
FD578012       --> ACCTCTC...........................................

               651    -    701
UN13690        --> TACTTC
                   ~~~~~~
FD583324       <-- ......
EW719413       <-- ......
EY903707       <-- ......
EY912370       <-- ......
FD530895       <-- ......
FD960618       <-- TACTTC
EY909620       <-- ......
FD959559       <-- ......
FD582217       <-- ......
FD579320       --> ......
FD964684       --> ......
EV526172       --> ......
EY948840       --> ......
EW715719       --> ......
EY907881       --> ......
EY913375       --> ......
EY916738       --> ......
FD535172       --> ......
FD963183       --> ......
FD578012       --> ......