1      -     51
UN21257        --> AAACTTATTAAGTTATACTCGGAGATTCCATACAGAGGCTAAACTATAAC
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- ..................................................
EY915118       <-- ..................................................
EY914481       <-- ..................................................
FY435912       --> AAACTTATTAAGTTATACTCGGAGATTCCATACAGAGGCTAAACTATAAC
EX899492       --> ..................................................
EY910520       --> ..................................................

               51     -    101
UN21257        --> AATGTCTTCACCTTGGAGACTCTATACGATCAGAGTTAAGATTTATTGAA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- .........................ACGATCAGAGTTAAGATTTATTGAA  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EY915118       <-- ...........................GATCAGAGTTAAGATTTATTGAA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY914481       <-- .....................................AAGATTTATTGAA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FY435912       --> AATGTCTTCACCTTGGAGACTCTATGCGATCAGAGTTAAGATTTATTGAA  Raphanus sativus cv GSK3-1
EX899492       --> .........................ACGATCAGAGTTAAGATTTATTGAA  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EY910520       --> .....................................AAGATTTATTGAA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)

               101    -    151
UN21257        --> GAACGTATCTGTTGTTTCAAATGGACAGACAATATCCGATTATAACAAAG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- GAACGTATCTGTTGTTTCAAATGGACAGACAATATCCGATTATAACAAAG  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EY915118       <-- AAACGTATCTGTTGTTTCAAATGGACAGACAATATCCGATTATAACAAAG  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY914481       <-- AAACGTATCTGTTGTTTCAAATGGACAGACAATATCCGATTATAACAAAG  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FY435912       --> GAACGTATCTGTTGTTTCAAATGGACAGACAATATCCGATTATAACAAAG  Raphanus sativus cv GSK3-1
EX899492       --> GAACGTATCTGTTGTTTCAAATGGACAGACAATATCCGATTATAACAAAG  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EY910520       --> AAACGTATCTGTTGTTTCAAATGGACAGACAATATCCGATTATAACAAAG  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)

               151    -    201
UN21257        --> TTATTACACCAGAGTTTTCATATCTCTCTCCCCCCTCTCTCTCTCTCTGG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- TTATTACACCAGAGTTTTCATATCTCTC-CCCCCC-CTCTCTCTCTCTGG  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EY915118       <-- TTATTACACCAGAGTTTTCATATCTCTCTCCCCCCTCTCTCTCTCTCTGG  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY914481       <-- TTATTACACCAGAGTTTTCATATCTCTCTCCCCCCTCTCTCTCTCTCTGG  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FY435912       --> TTATTACACCAGAGTTTTCATATCTCTC-CCCCCC-CTCTCTCTCTCTGG  Raphanus sativus cv GSK3-1
EX899492       --> TTATTACACCAGAGTTTTCATATCTCTC-CCCCCC-CTCTCTCTCTCTGG  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EY910520       --> TTATTACACCAGAGTTTTCATATCTCTCTCCCCCCTCTCTCTCTCTCTGG  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)

               201    -    251
UN21257        --> TCTCTAAACTCATTCGCCCTGAGCAGCTCCTCCATCTTCACCGGATGGAG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- TCTCTAAACTCATTCGCCCTGAGCAGCTCCTCCATCTTCACCGGATGGAG
EY915118       <-- TCTCTAAACTCATTCGCCCTGAGCAGCTCCTCCATCTTCACCGGATGGAG
EY914481       <-- TCTCTAA-CTCATTCGCCCTGAGCAGCTCCTCCATCTTCACCGGATG--G
FY435912       --> TCTCTAAACTCATTCGCCCTGAGCAGCTCCTCCATCTTCACCGGATGGAG
EX899492       --> TCTCTAAACTCATTCGCCCTGAGCAGCTCCTCCATCTTCACCGGATGGAG
EY910520       --> TCTCTAA-CTCATTCGCCCTGAGCAGCTCCTCCATCTTCACCGGATGG--

               251    -    301
UN21257        --> CACATGGAGACTTCCTGTAACGCGTCTGCTGCTGCGTTGGCTGTAACTTG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- CACATGGAGACTTCCTGTAACGCGTCTGCTGCTGCGTTGGCTGTAACTTG
EY915118       <-- CACATGGAGACTTCCTGTAACGCGTCTGCTGCTGCGTTGGCTGTAACTTG
EY914481       <-- CACATGGAGACTTCCTGTAACGCGTCTGCTGCTGCGTTGGCTGTAACTTG
FY435912       --> CACATGGAGACTTCCTGTAACGCGTCTGCTGCTGCGTTGGCTGTAACTTA
EX899492       --> CACATGGAGACTTCCTGTAACGCGTCTGCTGCTGCGTTGGCTGTAACTTG
EY910520       --> CACATGGAGACTTCCTGTAACGCGTCTGCTGCTGCGTTGGCTGTAACTTG

               301    -    351
UN21257        --> GGACGAAGAGCTTCTAAGGGTCCCTTTGGCTTAGCAACACCTTGCTTTCC
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- GGACGAAGAGCTTCTAAGGGTCCCTTTGGCTTAGCAACACCTTGCTTTCC
EY915118       <-- GGACGAAGAGCTTCTAAGGGTCCCTTTGGCTTAGCAACACCTTGCTTTCC
EY914481       <-- GGACGAAGAGCTTCTAAGGGTCCCTTTGGCTTAGCAACACCTTGCTTTCC
FY435912       --> GGACGAAGAGCTTCTAAGGGTCCCTTTGGCTTAGCAACACCTTGCTTTCC
EX899492       --> GGACGAAGAGCTTCTAAGGGTCCCTTTGGCTTAGCAACACCTTGCTTTCC
EY910520       --> GGACGAAAAGCTTCTAAGGGTCCCTTTGGCTTAGCAACACCTTGCTTTCC

               351    -    401
UN21257        --> AAGAGCCCAGTCAGCTGAGTCAAAGTATGCTCGTTCATGATCCTTGGAAA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- AAGAGCCCAGTCAGCTGAGTCAAAGTATGCTCGTTCATGATCCTTGGAAA  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EY915118       <-- AAGAGCCCAATCAGCTGAGTCAAAGTATGCTCGTTCATGATCCTTGGAAA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY914481       <-- AAGAGCCCAATCAGCTGAGTCAAAGTATGCTCGTTCATGATCCTTGGAAA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FY435912       --> AAGAGCCCAGTCAGCTGAGTCAAAGTATGCTCGTTCATGATCCTTGGAAA  Raphanus sativus cv GSK3-1
EX899492       --> AAGAGCCCAGTCAGCTGAGTCAAAGTATGCTCGTTCATGATCCTTGGAAA  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EY910520       --> AAGAGCCCAATCAGCTGAGTCAAAGTATGCTCGTTCATGATCCTTGGAAA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)

               401    -    451
UN21257        --> TGAGAGGTGGTTTCTTTGGCATGAGTCCTCCATACTTGTTCTTTACAGCA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- TGAGAGGTGGTTTCTTTGGCATGAGTCCTCCATACTTGTTCTTTACAGCA
EY915118       <-- TGAGAGGTGGTTTCTTTGGCATGAGTCCTCCATACTTGTTCTTTACAGC-
EY914481       <-- TGAGAGGTGGTTTCTTTGGCATGAGTCCTCCATACTTGTTCTTTACAGCA
FY435912       --> TGAGAGGTGGTTTCTTTGGCATGAGTCCTCCATACTTGTTCTTTACAGCA
EX899492       --> TGAGAGGTGGTTTCTTTGGCATGAGTCCTCCATACTTGTTCTTTACAGCA
EY910520       --> TGAGAGGTGGTTTCTTTGGCATGAGTCCTCCATACTTGTTCTTTACAGCA

               451    -    501
UN21257        --> -TCTCCTCTTGCTGTGATGATGGCATTGAATTATCTGCGTCATTTGTGAG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- -TCTCCTCTTGCTGTGATGATGGCATTGAATTATCTGCGTCATTTGTGAG
EY915118       <-- --AGCCTCTTGCTGTGATGATGGCATTGAATTATCTGCGTCATTGGTGAG
EY914481       <-- GCCTCCTCTTGCTGTGATc...............................
FY435912       --> GTCTCCTCTTGCTGTGATGATGGCATTGAATTATCTGCGTCATTTGTGAG
EX899492       --> -TCTCCTCTTGCTGTGATGATGGCATTGAATTATCTGCGTCATTTGTGAG
EY910520       --> GCCTCCTCTTGCTGTGATc...............................

               501    -    551
UN21257        --> GTTCCCTTGCTCTTTCACATCCTCTACGCTTGACATTTCTGATGATGTCT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- GTTCCCTTGCTCTTTCACATCCTCTACGCTTGACATTTCTGATGATGTCT
EY915118       <-- GTTCCCTTGCTCTTTCACATCCTCTACGCTTGACATTTCTGATGATGTCT
EY914481       <-- ..................................................
FY435912       --> GTTCCCTTGCTCTTTCACATCCTCTACGCTTGACATTTCTGATGATGTCT
EX899492       --> GTTCCCTTGCTCTTTCACATCCTCTACGCTTGACATTTCTGATGATGTCT
EY910520       --> ..................................................

               551    -    601
UN21257        --> CCTCAACGCCCACCAAAATCAGGGAGGAAGGATTTGCGATTGGCTCCTAT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- CCTCAACGCCCACCAAAATCAGGGAGGAAGGATTTGCGATTGGCTCCTAT
EY915118       <-- CCTCAACGCCCACCAAAATCAGG-AGGAAGGATTCGCGATTGGCTC----
EY914481       <-- ..................................................
FY435912       --> CCTCAACGCCCACCAAAATCAGGGAGGAAGGATTTGCGATTGGCTCCTAT
EX899492       --> CCTCAACGCCCACCAAAATCAGGGAGGAAGGATTTGCGATTGGCTCCTAT
EY910520       --> ..................................................

               601    -    651
UN21257        --> CTCTGTGTTGGTTGCGACGTTTCTTTTGTTGTTGATGTTGTTCC
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EX895360       <-- CTCTGTGTTGGTTGCGACGTTTCTTTTGTTGTTGATGTTGTTCC
EY915118       <-- -CTATTGTTGGTTGCGACGTTTCT-CTGTTGATGTTGTTc....
EY914481       <-- ............................................
FY435912       --> CTCTGTGTTGGTTGCGAC..........................
EX899492       --> CTCTGTGTTGGTTGCGACGTTTCTTTTGTTGTTGATGTTGTTCC
EY910520       --> ............................................