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Alignment for radish unigene UN23015

               1      -     51
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               101    -    151
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               151    -    201
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               201    -    251
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               251    -    301
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               301    -    351
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               351    -    401
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               401    -    451
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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FY432447       <-- ACCTAACTCCTCGACGCAGTCTCTCATGGCCGAGACTTCTCTTGGCTTGA
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EY914631       <-- ...ctACTCCTCGACGCAGTCTCTCATG-CCGAGACTTCT-TTGGCTTGA
FY436332       --> ACCTAACTCCTCGACGCAGTCTCTCATGGCCGAGACTTCTCTTGGCTTGA
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EX777325       --> ACCTAACTCCTCGACGCAGTCTCTCATGGCCAAAACTTCTCTTGGCTTGA

               451    -    501
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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EY914631       <-- -CCGTCTACTACTCGAGAGACGCACCATCATTACTGATGTAGCTTT-GCC
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EW727153       --> GCCGTCTACTACTCGAGAGACGCACCATCATTACTGATGTAGCTTTTGCC
EW727453       --> GCCGTCTACTACTCGAGAGACGCACCATCATTACTGATGTAGCTTTTGCC
FD545592       --> GCCGTCTACTACTCGAGAGACGCACCATCATTACTGATGTAGCTTTTGCC
EY910633       --> ..................................................
EX777325       --> GCCGTCTACTACT.....................................

               501    -    551
UN23015        --> GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EY941102       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGc....................  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FY432447       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus cv GSK3-1
EV529358       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD560435       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTCAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus var. oleiformis
FD941575       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTCAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus var. oleiformis
EX773526       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus raphanistrum subsp. landra
EW722606       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW722607       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD549541       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGTGGCTGGT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EV551504       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGTGGCTGGT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY914631       <-- GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGTGGCTGGT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FY436332       --> GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus cv GSK3-1
FD564836       --> GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTCAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus var. oleiformis
FD937187       --> GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTCAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus var. oleiformis
EV533120       --> GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EW727153       --> GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW727453       --> GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGGGGCTGGT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD545592       --> GAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATAAGCTTGTGGCTGGT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY910633       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX777325       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. landra

               551    -    601
UN23015        --> TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EY941102       <-- ..................................................  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FY432447       <-- TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus cv GSK3-1
EV529358       <-- TTGGATGAGACTGGAATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD560435       <-- TTGGATGAGACTGGCATGAGTCGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus var. oleiformis
FD941575       <-- TTGGATGAGACTGGCATGAGTCGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus var. oleiformis
EX773526       <-- TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus raphanistrum subsp. landra
EW722606       <-- TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGAGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW722607       <-- TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGAGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD549541       <-- TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EV551504       <-- TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
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FY436332       --> TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus cv GSK3-1
FD564836       --> TTGGATGAAACTGGCATGAGTCGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus var. oleiformis
FD937187       --> TTGGATGAAACTGGCATGAGTCGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus var. oleiformis
EV533120       --> TTGGATGAGACTGGAATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EW727153       --> TTGGATGAAACTGGCATGAGTTGAGAGAGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW727453       --> TTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGAGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD545592       --> TTGGATGAAACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTCTTGGAT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY910633       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX777325       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. landra

               601    -    651
UN23015        --> ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EY941102       <-- ..................................................  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FY432447       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus sativus cv GSK3-1
EV529358       <-- ATGTTGTGACTGTGCACGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD560435       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGT-  Raphanus sativus var. oleiformis
FD941575       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGT-  Raphanus sativus var. oleiformis
EX773526       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus raphanistrum subsp. landra
EW722606       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW722607       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD549541       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EV551504       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY914631       <-- ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FY436332       --> ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus sativus cv GSK3-1
FD564836       --> ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGT-  Raphanus sativus var. oleiformis
FD937187       --> ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGT-  Raphanus sativus var. oleiformis
EV533120       --> ATGTTGTGACTGTGCACGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EW727153       --> ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW727453       --> ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD545592       --> ATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY910633       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX777325       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. landra

               651    -    701
UN23015        --> GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EY941102       <-- ..................................................  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FY432447       <-- GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus sativus cv GSK3-1
EV529358       <-- GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD560435       <-- GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus sativus var. oleiformis
FD941575       <-- GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus sativus var. oleiformis
EX773526       <-- GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus raphanistrum subsp. landra
EW722606       <-- GTATGGACCGACTTGATTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW722607       <-- GTATGGACCGACTTGATTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD549541       <-- GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
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FD564836       --> GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus sativus var. oleiformis
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EW727153       --> GTATGGACCGACTTGATTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW727453       --> GTATGGACCGACTTGATTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD545592       --> GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAG  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY910633       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX777325       --> ..................................................  Raphanus raphanistrum subsp. landra

               701    -    751
UN23015        --> AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EY941102       <-- ..................................................
FY432447       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTaaa
EV529358       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTT...
FD560435       <-- AGACGTGAGGAA......................................
FD941575       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
EX773526       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
EW722606       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
EW722607       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
FD549541       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
EV551504       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
EY914631       <-- AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
FY436332       --> AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAA....................
FD564836       --> AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
FD937187       --> AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
EV533120       --> AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTT..
EW727153       --> AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
EW727453       --> AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
FD545592       --> AGACGTGAGGAAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAA
EY910633       --> ..................................................
EX777325       --> ..................................................

               751    -    801
UN23015        --> AATATATGTTATGAGCTTTATGATAATGTTATGATATATGTGTTGCCC
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EY941102       <-- ................................................  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FY432447       <-- ................................................  Raphanus sativus cv GSK3-1
EV529358       <-- ................................................  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD560435       <-- ................................................  Raphanus sativus var. oleiformis
FD941575       <-- AATATATGTTATGAGCTTTATGATAATGTTATGATATATGTGTTGCCC  Raphanus sativus var. oleiformis
EX773526       <-- AATATATGTTATGAGCTTTATGACAATGTTATGATATATGTGTTcc..  Raphanus raphanistrum subsp. landra
EW722606       <-- AATATATGTTATGAGCTTTATGACAATGTTATGATATATcc.......  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW722607       <-- AATATATGTTATGAGCTTTATGACAATGTTATGATATATcc.......  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD549541       <-- AATATATGTTATGAGCTTTATGATAATGTTATGATATATGTGTTGCC.  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EV551504       <-- AATATATGTTATGAGCTTTATGATAATGTTATGATATATGTGTTcc..  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY914631       <-- AATATATGTTATGAGCTTTATGATAATGTTATGATATATcc.......  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FY436332       --> ................................................  Raphanus sativus cv GSK3-1
FD564836       --> AATATATGTTATGAGCTTTATGATAATGTTATGATATATGTGTTGCCC  Raphanus sativus var. oleiformis
FD937187       --> AATATATGTTATGAGCTTTATGATAATGTTATGATATATGTGTTGCCC  Raphanus sativus var. oleiformis
EV533120       --> ................................................  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EW727153       --> AATATATGTTATGAGCTTTATGACAATGTTATGATATATcc.......  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
EW727453       --> AATATATGTTATGAGCTTTATGACAATGTTATGATATATcc.......  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
FD545592       --> AATATATGTTATGAGCTTTATGATAATGTTATGATATATGTGTTGCC.  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EY910633       --> ................................................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX777325       --> ................................................  Raphanus raphanistrum subsp. landra