1      -     51
UN24890        --> GGGTTCAATATTAAGGTTGTGACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- ..................ggGACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGT
EX767185       <-- ..................................................
FD976730       <-- ..................................................
EX763035       --> GGGTTCAATATTAAGGTTGTGACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGT
FD563442       --> .......ggATTAAGGTTGTGACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGT
FD980923       --> ...........gAAGGTTGTGACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGT
EW717489       --> ..................ggGACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGT

               51     -    101
UN24890        --> AGAATAAAATAAAAATTCTGCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- AGAATAAAATAAAAATTCTGCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGT
EX767185       <-- ...................GCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGT
FD976730       <-- ..................................................
EX763035       --> AGAATAAAATAAAAATTCTGCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGT
FD563442       --> AGAATAAAATAAAAATTCTGCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGT
FD980923       --> AGAATAAAATAAAAATTCTGCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGT
EW717489       --> AGAATAAAATAAAAATTCTGCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGT

               101    -    151
UN24890        --> TAAAATAGTTTTTTTATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAAAATGGAGTA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- TAAAATAGTTTTTT-ATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAAAATGGAGTA  Raphanus sativus var. oleiformis
EX767185       <-- TAAAATAGTTTTTTTATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAAAATGGAGTA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD976730       <-- ........TTTTTTTATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAAAATGGAGTA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX763035       --> TAAAATAGTTTTTTTATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAAAATGGAGTA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD563442       --> TAAAATAGTTTTTT-ATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAAAATGGAGTA  Raphanus sativus var. oleiformis
FD980923       --> TAAAATAGTTTTTTTATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAAAATGGAGTA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EW717489       --> TAAAATAGTTTTTT-ATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAAAATGGAGTA  Raphanus sativus var. oleiformis

               151    -    201
UN24890        --> ATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAA-TATCATTTTCACTT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- ATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAAATATCATTTTCACTT  Raphanus sativus var. oleiformis
EX767185       <-- ATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAA-TATCATTTTCACTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD976730       <-- ATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAA--TATCATTTTCACTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX763035       --> ATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAA-TATCATTTTCACTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD563442       --> ATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAAATATCATTTTCACTT  Raphanus sativus var. oleiformis
FD980923       --> ATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAA--TATCATTTTCACTT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EW717489       --> ATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAAATATCATTTTCACTT  Raphanus sativus var. oleiformis

               201    -    251
UN24890        --> TTTCTGATTTCAAGTTTTTTCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAAC
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- TTTCTGATTTCAAGTTTTTCCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAAC  Raphanus sativus var. oleiformis
EX767185       <-- TTTTTGATTTCAAGTTTTTTCCATTTTTTTAATTAATTAGTAATCAAAAC  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD976730       <-- TTTCTGATTTCAAGTTTTTTCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAAC  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX763035       --> TTTCTGATTTCAAGTTTTTTCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAAC  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD563442       --> TTTCTGATTTCAAGTTTTTCCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAAC  Raphanus sativus var. oleiformis
FD980923       --> TTTCTGATTTCAAGTTTTTTCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAAC  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EW717489       --> TTTCTGATTTCAAGTTTTTCCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAAC  Raphanus sativus var. oleiformis

               251    -    301
UN24890        --> TTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- TTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGG
EX767185       <-- TTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGG
FD976730       <-- TTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGG
EX763035       --> TTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGG
FD563442       --> TTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGG
FD980923       --> TTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGG
EW717489       --> TTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGG

               301    -    351
UN24890        --> AGACCTAACCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATAT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- AGACCTAACCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATAT
EX767185       <-- AGACCTAACCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATAT
FD976730       <-- AGACCTAACCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATAT
EX763035       --> AGACCTAACCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATAT
FD563442       --> AGACCTAACCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATAT
FD980923       --> AGACCTAACCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATAT
EW717489       --> AGACCTAACCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATAT

               351    -    401
UN24890        --> CTCAGTTTCGAGGTTCAATGATCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTAC
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- TTCAGTTTCGAGGTTCAATGACCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTTTAC
EX767185       <-- TTCAGTTTCGAGGTTCAATGATCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTTTAC
FD976730       <-- CTCAGTTTCGAGATTCAATGATCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTAC
EX763035       --> CTCAGTTTCGAGGTTCAATGATCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTAC
FD563442       --> CTCAGTTTCGAGGTTCAATGATCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTAC
FD980923       --> CTCAGTTTCGAGATTCAATGATCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTAC
EW717489       --> CTCAGTTTCGAGGTTCAATGACCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTAC

               401    -    451
UN24890        --> AGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGAGAGAAGGAT
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- AGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGAGAGAAGGAT
EX767185       <-- AGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGAGAGAAGGAT
FD976730       <-- AGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGAGAGAAGGAT
EX763035       --> AGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGAGAGAAGGAT
FD563442       --> AGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGAGAGAAGGAT
FD980923       --> AGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGAGAGAAGGAT
EW717489       --> AGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGAGAGAAGGAT

               451    -    501
UN24890        --> TTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- TTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCA
EX767185       <-- TTTGTGTTGTGGATTTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCA
FD976730       <-- TTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCA
EX763035       --> TTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCA
FD563442       --> TTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCA
FD980923       --> TTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCA
EW717489       --> TTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCA

               501    -    551
UN24890        --> AAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- AAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGA
EX767185       <-- AAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGA
FD976730       <-- AAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGA
EX763035       --> AAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGA
FD563442       --> AAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGA
FD980923       --> AAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGA
EW717489       --> AAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGA

               551    -    601
UN24890        --> TTAAATCTGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- TTAAATATGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTA  Raphanus sativus var. oleiformis
EX767185       <-- TTAAATCTGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATTTA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD976730       <-- TTAAATCTGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX763035       --> TTAAATCTGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD563442       --> TTAAATATGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTA  Raphanus sativus var. oleiformis
FD980923       --> TTAAATCTGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EW717489       --> TTAAATATGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTA  Raphanus sativus var. oleiformis

               601    -    651
UN24890        --> GGGTTGGGCATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTG
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- GGGTTGGGCATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTG
EX767185       <-- GGGTTGGGCATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTG
FD976730       <-- GGGTTGGGCATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTG
EX763035       --> GGGTTGGGCATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTG
FD563442       --> GGGTTGGGCATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTG
FD980923       --> GGGTTGGGCATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTG
EW717489       --> GGGTTGGGCATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTG

               651    -    701
UN24890        --> ATTTGCTTTGTACGAATAATACATTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- ATTTGCCTTGTACGAATAATACATTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAA  Raphanus sativus var. oleiformis
EX767185       <-- ATTTGCTTTGTA......................................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD976730       <-- ATTTGCTTTGTACGAATAATACATTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX763035       --> ATTTGCTTTGTA......................................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD563442       --> ATTTGCCTTGTACGAATAATACATTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAA  Raphanus sativus var. oleiformis
FD980923       --> ATTTGCTTTGTACGAATAATACATTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EW717489       --> ATTTGCCTTGTACGAATAATACATTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAA  Raphanus sativus var. oleiformis

               701    -    751
UN24890        --> AAACGAGTATTTGTTATTTCGAGTACTTTATCAAACATTAATTACTTGGA
                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EW721194       <-- AAACGAGTATTTGTTATTTCGAGTACTTTATCAAACATTAATTACTTGG.
EX767185       <-- ..................................................
FD976730       <-- AAACGAGTATTTGTTATTTCGAGTACTTTATCAAACATGAATTACTTGG.
EX763035       --> ..................................................
FD563442       --> AA-CGAGTATTTGTTATTTCG.............................
FD980923       --> AAACGAGTATTTGTTATTTCGAGTACTTTATCAA-CATGAATTACTTGGA
EW717489       --> AA-CGAGTATTTGTTATTTCGAGTACTTTATCAA-CATTAATTACTTGG.

               751    -    801
UN24890        --> AA
                   ~~
EW721194       <-- ..
EX767185       <-- ..
FD976730       <-- ..
EX763035       --> ..
FD563442       --> ..
FD980923       --> AA
EW717489       --> ..