-4     -     46
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               46     -     96
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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EX753533       <-- TTCTGGAATTATGAGGTTGGCTATTTTATTAATAGTTTTTGGTATTTTCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD555077       <-- TTCTGGAATTATGAGGTTGGCTATTTTATTAATAATTTTTGGTATTTTCA  Raphanus raphanistrum subsp. landra
EX763529       --> TTCTGGAATTATGAGGTTGGCTATTTTATTAATAATTTTTGGTATTTTCA  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX896713       --> TTCTGGAATTATGAGGTTGGCTATTTTATTAATAATTTTTGGTATTTTCA  Raphanus sativus cv Early Scarlet Globe
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FD533513       --> TTCTGGAATTATGAGGTTGGCTATTTTATTAATAGTTTTTGGTATTTTCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
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EY899889       --> TTCTGGAATTATGAGGTTGGCTATTTTATTAATAGTTTTTGGTATTTTCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EX749963       --> TTCTGGAATTATGAGGTTGGCTATTTTATTAATAGTTTTTGGTATTTTCA  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD559357       --> TTCTGGAATTATGAGGTTGGCTATTTTATTAATAATTTTTGGTATTTTCA  Raphanus raphanistrum subsp. landra

               96     -    146
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               146    -    196
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               196    -    246
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               246    -    296
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               296    -    346
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               346    -    396
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               396    -    446
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               446    -    496
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               496    -    546
UN25252        --> CTCTAGC
                   ~~~~~~~
EX767590       <-- CTCT...
EX900597       <-- CTCTAG.
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EX753533       <-- .......
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EY898604       --> .......
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EY899889       --> .......
EX749963       --> .......
FD559357       --> .......