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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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EX891378       <-- ....ggACCAAAAGAACACAAACCTATAAACAATGACTGACGCAACAGAA
FD547462       <-- ....ggACCAAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCAACAGAA
EX759278       <-- ..................................................
EY929783       --> .GGGATACCAAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCGACAGAA
FD986688       --> .GGGATACCAAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCAACAGAA
FD550411       --> ..GGATACCAAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCAACAGAA
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EX887160       --> .......................CTATAAACAATGACTGACGCAACAGAA
EX755119       --> ..................................................

               50     -    100
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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EX755119       --> ..................................................

               100    -    150
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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               150    -    200
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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EY929783       --> TCACACACGACGACATTAAGCGTATGATGGCCGAGATTGATACGGATGGT
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EX755119       --> ..................................................

               200    -    250
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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EX755119       --> ..................................................

               250    -    300
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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FD546376       <-- TGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTTTAAACGATATTATCAAATT
EX891378       <-- TGGTCTCATGAAAGATG.................................
FD547462       <-- TGGTTTCTTGAAAGATGTGGCCAAGATTTTTTAAACGATATTATCAAATT
EX759278       <-- TGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATT
EY929783       --> TGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATT
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FD972165       --> TGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATT
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EX755119       --> ...........................................TCAAATT

               300    -    350
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD982895       <-- TTATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCT  Raphanus raphanistrum subsp. landra
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EX891378       <-- ..................................................  Raphanus sativus var. oleiformis
FD547462       <-- TTATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTTTTAATGACAATCATCT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
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FD986688       --> TTATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCT  Raphanus raphanistrum subsp. landra
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FD939826       --> TTATTTGAGAGACAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCT  Raphanus sativus var. oleiformis
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EX755119       --> TTATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCT  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)

               350    -    400
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD982895       <-- GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
FD546376       <-- GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
EX891378       <-- ..................................................
FD547462       <-- GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
EX759278       <-- GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
EY929783       --> GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
FD986688       --> GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
FD550411       --> GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
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FD962661       --> GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
EV537201       --> GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
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FD551597       --> GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
EX887160       --> GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG
EX755119       --> GATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATG

               400    -    450
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                   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
FD982895       <-- ATATAATcg.........................................  Raphanus raphanistrum subsp. landra
FD546376       <-- ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTAAggat.................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX891378       <-- ..................................................  Raphanus sativus var. oleiformis
FD547462       <-- ATAATTTTGAAAATTCTCGATTCTTTTAACGGTAAAAAGATTTGGTTCT.  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX759278       <-- ATATAATTGAAAATTCTC................................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
EY929783       --> ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTAAGGGTAAAAA............  Raphanus sativus var. oleiformis
FD986688       --> ATATAATcg.........................................  Raphanus raphanistrum subsp. landra
FD550411       --> ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTAAggat.................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
FD939826       --> ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTt......................  Raphanus sativus var. oleiformis
FD962661       --> ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTAAGGGT.................  Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EV537201       --> ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTAACGGT.................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
FD972165       --> ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTT.......................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)
FD551597       --> ATAATTTTGAAAATTCTCGATTCTTTTAACGGTAAAAAGATTTGGTTCT.  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (NY)
EX887160       --> ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTAAGGGTAAAAAGATTTGGTTCTA  Raphanus sativus var. oleiformis
EX755119       --> ATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTAACGat.................  Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum (MS)

               450    -    500
UN26238        --> GAC
                   ~~~
FD982895       <-- ...
FD546376       <-- ...
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