1 - 51
UN39089 --> GGGAAGGGACTTATCTACGAAGCAAATAAGCGATAATGGCGGATCAACAA
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- GGGAAGAGACTTATCTACGAAGCAAATAAGCGATAATGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. landra
EV570836 <-- GGGAAGAGACTTATCTACGAAGCAAATAAGCGATAATGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. landra
FD529916 <-- .....GGGACTTATCTACGAAGCAAATAAGCGATAATGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD531890 <-- ....................................TGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD960965 <-- ....................................TGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EV565540 --> GGGAAGAGACTTATCTACGAAGCAAATAAGCGATAATGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. landra
EV529154 --> .....GGGACTTATCTACGAAGCAAATAAGCGATAATGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD533846 --> .....GGGACTTATCTACGAAGCAAATAAGCGATAATGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD536131 --> ....gGGGACTTATCTACGAAGCAAATAAGCGATAATGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD534335 --> .........................ggAAGCGATAATGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD536419 --> ....................................TGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
FD965143 --> ....................................TGGCGGATCAACAA Raphanus raphanistrum subsp. maritimus
EV565539 --> .................................................. Raphanus raphanistrum subsp. landra
51 - 101
UN39089 --> GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
EV570836 <-- GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
FD529916 <-- GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
FD531890 <-- GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
FD960965 <-- GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
EV565540 --> GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
EV529154 --> GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
FD533846 --> GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
FD536131 --> GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTAGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
FD534335 --> GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
FD536419 --> GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
FD965143 --> GGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGA
EV565539 --> ..................................................
101 - 151
UN39089 --> TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
EV570836 <-- TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
FD529916 <-- TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
FD531890 <-- TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
FD960965 <-- TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
EV565540 --> TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
EV529154 --> TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
FD533846 --> TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
FD536131 --> TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
FD534335 --> TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
FD536419 --> TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
FD965143 --> TCTTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
EV565539 --> ..TTCAAGTGGAGAGTCTAGCTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGA
151 - 201
UN39089 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
EV570836 <-- AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
FD529916 <-- AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
FD531890 <-- AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
FD960965 <-- AGGAGAACGTGAGTTTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
EV565540 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
EV529154 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
FD533846 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
FD536131 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
FD534335 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
FD536419 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
FD965143 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
EV565539 --> AGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAG
201 - 251
UN39089 --> GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
EV570836 <-- GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
FD529916 <-- GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
FD531890 <-- GTAGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
FD960965 <-- GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
EV565540 --> GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
EV529154 --> GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
FD533846 --> GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
FD536131 --> GTTGTGGCAGGAACAATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
FD534335 --> GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
FD536419 --> GTAGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
FD965143 --> GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
EV565539 --> GTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
251 - 301
UN39089 --> AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
EV570836 <-- AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
FD529916 <-- AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
FD531890 <-- AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
FD960965 <-- AAAGAAGAAGGTTTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
EV565540 --> AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
EV529154 --> AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
FD533846 --> AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
FD536131 --> AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
FD534335 --> AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
FD536419 --> AAAGAAGAAGGTCTA...................................
FD965143 --> AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
EV565539 --> AAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
301 - 351
UN39089 --> TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
EV570836 <-- TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
FD529916 <-- TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
FD531890 <-- CCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
FD960965 <-- TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
EV565540 --> TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
EV529154 --> TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
FD533846 --> TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
FD536131 --> TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
FD534335 --> TCAAGAAGTTGGAGTCCTCCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
FD536419 --> ..................................................
FD965143 --> TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
EV565539 --> TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATAC
351 - 401
UN39089 --> CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
EV570836 <-- CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
FD529916 <-- CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
FD531890 <-- CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
FD960965 <-- CTGAGACTGTCTATTAAACACATCGCATTTTACGTGATAATTAAGAGTCC
EV565540 --> CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
EV529154 --> CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
FD533846 --> CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
FD536131 --> CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
FD534335 --> CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
FD536419 --> ..................................................
FD965143 --> CTGAGACTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
EV565539 --> CTGAGATTGTCTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCC
401 - 451
UN39089 --> CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
EV570836 <-- CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
FD529916 <-- CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
FD531890 <-- CGGTTTAAC-AATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
FD960965 <-- CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
EV565540 --> CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
EV529154 --> CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
FD533846 --> CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
FD536131 --> CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
FD534335 --> CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
FD536419 --> ..................................................
FD965143 --> CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
EV565539 --> CGGTTTAACCAATGGGTTAACTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATT
451 - 501
UN39089 --> CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
EV570836 <-- CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
FD529916 <-- CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
FD531890 <-- CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
FD960965 <-- CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
EV565540 --> CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
EV529154 --> CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
FD533846 --> CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
FD536131 --> CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
FD534335 --> CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
FD536419 --> ..................................................
FD965143 --> CTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAATGTGTAATGGAACTAGTATGG
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501 - 551
UN39089 --> TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCAAGTTGCAAAC
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCAAGTTGCAAAC
EV570836 <-- TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCAAGTTGCAAAC
FD529916 <-- TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCAAGTTGC....
FD531890 <-- TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGT....................
FD960965 <-- TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCAAGTTGCAAAC
EV565540 --> TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCAAGTTGCAAAC
EV529154 --> TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTC.........................
FD533846 --> TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCAAGTTG.....
FD536131 --> TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTC.........................
FD534335 --> TGTTTAT...........................................
FD536419 --> ..................................................
FD965143 --> TGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCAAGTTGCAAAC
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551 - 601
UN39089 --> TTTTTTACTTT
~~~~~~~~~~~
EV570835 <-- TTTTTTACTaa
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FD529916 <-- ...........
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FD965143 --> TTTTTTACTTT
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