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Simple sequence repeat (SSR)
>UN54823
GGGCTCCTCAACTCGAAAGCAGAGAGAGAAAAAAAAATAAGAGAGAGAGAGAGATTCAGAGAGAAAGGAGGGAGAAGAAAGGAGCTAAGTGGTC
TCATCACCATTACCAGCTCCATTCGAACATAAACATTAAACGACGTCGTTCCCTCTACCATCCTCTGGAATCTCTCCTCCCACCAGTTTCTCTC
AGTTTTATTTCGGGTTTTAATTTACGAGAGGAGATCTTGTCTACCCGTGGAATTGCGTTTTCCTCTTCACCAAGATCGTCCCCGACGGTAACGT
CTTGATTTTGATTTATTTGGGTCTCCTCTCCTCCAGCATTTAAGGTGTAGGTATCTTCTTAACGAGTATTCTATCTGGTTTAAATTAACGTTAA
TTGTAATCGGAGGAACTCTTTGATTACCATTATTGCACCAACTTCTATAGAAAAAGTTAGGCCCTTTTTGGTAGATTTTGTTACTACGTGTCCA
CTAGGTTTGGTGATTCATGCTCTTTATCTGCATCACTGCTATGTAAACTCATAAGCTACCTAATTTTTAATTTCCCCACTTTGGGTCTTAACTC
TTGTCTGAGCTGTCGTGAAGAAAACTCTAAAACTGAGCTTACCCTTTGATGTTTAAAGCTCAAGTAACAATTGGAACGCTGTTTCTCTTGTGAT
TTGTCTTAATTGTACATTTCACATGTTTGTTCCTTTTGGCTATCACCTTGTCTTCATTATACATGTTCTACTTTAATCTTATAGATTTATCTTT
TCGTGTGTTTGCAGCA |
Primers for UN54823 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
GCTCCTCAACTCGAAAGCAG |
60.277 |
20 |
CGAATGGAGCTGGTAATGGT |
59.955 |
20 |
117 |
3 |
119 |
2 |
GCTCCTCAACTCGAAAGCAG |
60.277 |
20 |
CTTGGTGAAGAGGAAAACGC |
59.853 |
20 |
260 |
3 |
262 |
3 |
GCTCCTCAACTCGAAAGCAG |
60.277 |
20 |
GGGAGGAGAGATTCCAGAGG |
60.149 |
20 |
173 |
3 |
175 |
|
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