 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN54942
GGAGCGGTTCCATCACTACAAGGACTTTTGGATGCTGGACGTAAAAACTAACCAATGGGAACATTTAAATTTAAAGGGATGTCCTAGTCCCCGT
TCTGGTCATCGTATGGTATTATACAAGCACAAGATTATAGTTTTTGGTGTCTTCTATGACACTCTACGTGAAGTAAGGTATTACAATGATCTCT
ATGTGTTTGACTTGGACAAATACAAGTGGCAAGAAATAAAGCCTAAGCCTGGTGCCATGTGGCCTACAGCTAGAAGCGGTTTCCAGTTCTTTGT
TTATCAAGATGAGATATTCTTATATGGTGGTTATTCAAAAGAAGTCTCATCTGAGAAGAGCTCTGAGAAAGGAGTTGTTCATGCTGATTTATGG
TCTCTTGATCCCAGAACCTGGGAATGGAACAAAGTGAAGAAAATTGGGATGCCTCCTAGCTCCCGTGCAGGGTTTTCGGTATGTGTCCACAAAA
AGCGTGCTTTGCTGTTTGGTGGTGTCGTGGATATGGAAATGGAAGGTGATGTAATGATGAGTTTATTCTTAAATGAGCTCTATGGCTTCCAGTT
AGATAATCGCCGCTGGTACCCCATAGAGCTACGAAAAGAAAAATCATCAAAAGATAAGGCAAAGAAGAATTTAGAGGCCAAACCTATAGCATCT
AATGATGATGATGATGATGATGAGATGGATTCAGCAGAAGCCATGGGTGATGTGGCAGGCTCATCCGATGGGATTTCTGAACGTATGGCAGCAT
GTCTAACTGTTGAAAGAAGTACACTTAATGCTGAGTCTGATAAAAG |
Primers for UN54942 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TCCAGTTAGATAATCGCCGC |
60.196 |
20 |
ACATGCTGCCATACGTTCAG |
59.746 |
20 |
197 |
558 |
754 |
| 2 |
TGGTGTCGTGGATATGGAAA |
59.774 |
20 |
ACATGCTGCCATACGTTCAG |
59.746 |
20 |
265 |
490 |
754 |
| 3 |
TTGGTGGTGTCGTGGATATG |
60.24 |
20 |
ACATGCTGCCATACGTTCAG |
59.746 |
20 |
269 |
486 |
754 |
|
|
