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Simple sequence repeat (SSR)
>UN58224
GGAAGCCTTTCTGCTTCCATTGTTCCATTTTATCAGATGGGGTTTGCCAAGCAAGCTTCTAGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTATACCC
TTAAAATGCCACCACCTCCTAGGGAGGACACGCCTCTTCTCGGCAAAGGGCCTCCTCTTTCTAGCCAGTTCAAGACCTTCGCCAACATCTTCAT
TGCTGTCGTCGGCGCTGGTGTTCTTGGTCTTCCTTACGCCTTCAAGCGCACCGGATGGCTCATGGGCGTTCTCCTTCTCCTCTCCGTCTCTGTT
TTGACCCATCACTGTATGATGCTCCTCGTTTATACCCGCCGCAAGCTCGACTCTTTCAATGGCGGTGGTTTCTCCAAGATCGGCTCTTTTGGTG
ACCTTGGCTTTGCCGTCTGCGGTTCCCTCGGCAGGCTCGTCGTTGACCTCTTTATTATTTTGTCTCAAGCTGGCTTTTGTGTCGGATATCTTAT
CTTCATCGGCACTACTCTAGCTAATCTTTTCGATCCTGATTCCCCCACCAGTCTCAGGCATCAGTTTACACGCCTCGGTTCTGAATTCCTCGGA
GTCTCCTCTAAGAGTCTCTACATCTGGGGATGCTTCCCCTTCCAGCTTGGTCTCAACTCCATCAAGACCCTCACTCACTTGGCTCCTCTCAGCA
TCTTCGCCGACGTTGTTGATCTTGCCGCTATGGCCGTCGTCATTGTTGAGGATTCCATGATTATACTCAAGCAAAGCCTGACGTTGTTGCCTTT
GGTGGTATGTCCCTCTTCTTCTATGGG |
Primers for UN58224 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTTATCAGATGGGGTTTGCC |
59.762 |
20 |
ATGGGTCAAAACAGAGACGG |
59.966 |
20 |
263 |
29 |
291 |
| 2 |
TTTATCAGATGGGGTTTGCC |
59.762 |
20 |
AATGAAGATGTTGGCGAAGG |
60.074 |
20 |
161 |
29 |
189 |
| 3 |
TTTATCAGATGGGGTTTGCC |
59.762 |
20 |
AGATGTTGGCGAAGGTCTTG |
60.255 |
20 |
156 |
29 |
184 |
|
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