Simple sequence repeat (SSR)
>UN72315
GGTTTATGGGTTTAGCTTAAGGTTCTTCGATTTGATTGTTTGTGTAAGTTTATCTTTGATGGGTTTTCATTTGTATAACGTGCCTCACTTGTAG
AGTTACACTGATATGGGGTTTTGTAATTATTCATTATATCGACCTTTGTGCTTAGTTTCTTGATGGGTTTTGGTTTGATGGGTTTGATGATATA
TATATATATTTTGTCAGTCTTCACTTGATGGGTTTCTGGTTTAACTAGCTTTAGTTGTTTGCTTATCTTCATGTACAGAACAGAAGATAGAAGA
ATCTCTCAAGTACCTAAGGTAATAGGGTTTCCTGGACTCTCTCTCTCTATTTATCTTTTGTTATTATTACTCTCTTCATAAGACTTTTATGTTT
CTACAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCATCTTGAATTGCGCTTCGCTATAATTTTCCTCTTGAGAGATTTGTGATTGTTA
CTCTTCTGCGTTATGATAATGTAAAACGTTACCTTGCTAAAAA |
Primers for UN72315 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
GATGGGTTTTGGTTTGATGG |
60.029 |
20 |
CGAAGCGCAATTCAAGATG |
60.495 |
19 |
280 |
156 |
435 |
2 |
TTTTGGTTTGATGGGTTTGA |
58.841 |
20 |
TTATAGCGAAGCGCAATTCA |
59.585 |
20 |
280 |
162 |
441 |
3 |
TTTTGGTTTGATGGGTTTGA |
58.841 |
20 |
ATAGCGAAGCGCAATTCAAG |
60.497 |
20 |
278 |
162 |
439 |
|
|