Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN06407
TGATGAGCTGCTGCCGTGGTTCTCTCTGAGATCCTTCCTTCCTTGCCCTCTCTTTCTACTCACTCTCGGAACAAGTCCTCTCCAAGTGTTTCAG
CGCGTCAAGAACGTGGTTTGCTTGCCTCCTCTTCTTCTTCAGAAACTATCCCCTTGGTTATTGGTTCTGGCCACGGTACCAGTGCTCCAAGTAC
TAGATTGGTCTCAGATAGGATCTCGCCACCAATTGTTAGTCCTGGTGTTTTCCGCAAACATGTCGAAAGTGAGGAGCAAGTCCAATCTTTAGGA
AAGGTTCCTGACTATGATTTCTTTGCCAAGTCTTTTGATGTTCCCATCCTCCCAGAGGATGATGATCTTAACTCAGTGGTCCACGCTGTCCCAC
AAGAAAACCTCAAGTCTACTAGAGATTTTTGGCAAGAGCTTGGTGGTTCTCATATGACATGGAATCAAACAGATTCAATCACAAGCGTTGGTTC
ACTGAATGCTGCACAGAAGGGATCATGTTTTGAAGTTGGGACTGGGAGTACAAATGACCAGCCGTCAAAGGGTTCACTGGCCAGTGAAAACGGT
GATACTGAATCAAAGCGTTCACTGGCTAGTGTAAATGGTGATACTGAATCAAAGCGTTCATTGGCCTGTGTAAATGGAGATACTGAATTAGGTA
GTGCTTTCAGCTCATCAACTCATGGCTGCAGTGTTGATCACCTTGAAGAGATTTTCCAAGACGCCAAAACTAACAAGAGAACCTTGCTCGCTGT
GATGGACTTGGTTATGAATCTGATGAAAGAAGTTGAACTTGAAGAGAAGGATGCAGATAAGTCAGAGTTAGAAGCTGCTAGGGGAGGTTTGGAC
ACTCTTGAAAAGGTTGAGGAGTTCAGGAAGATGCTGAAACATGCCAAGGAAGCCAATGACATGCATGCTGGAGAAGTATATGGAGAGAAGTCAA
TTTTAGCAACTGAAGCAAAGGAGCTTGAAAACCGATTGCTCAAGTTATCAGAAGAGCGAAGCAAATCTCTTGATGTACTTGATGAGATGCGTGA
AACTCTTGAGATAAGACTAGCGGCAACATTGGAGATGAAAAAGGCTGCTGAGCAAGAAAAGAAAGCAAAAGAAGACTCTGCGCTTAAGGCACTT
GCTGAACAAGAGGCCATCATGGAGAAAGTAGCCCAAGAATCAAAGCTTCTTCAGCAAGAGGCAGAGCAAAACTCTAAGCTTCGAGAGTTTCTTA
TGGATCGTGGTGAGGTCGTTGATTCCTTACAAGGAGAAATATCTGTCATATGTCAAGATGTGAAGCTGTTGAAAGAAAAATTTGACAAGAGTGT
GTCAACAACAACAAAATCAGTTACCTCAAGCCTGACTAGTTCACGTGGATCATCATCTATGAGGAGCTTGGTGCTTGAGAATCCTGCTGAGCTG
TTGAATGGAATTTTTGAAACCTCAAGCAAGAACAAGAGCCCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCATCTTACTACATGAAGAAAGAGAAAA
ATGATCGTAGAGAGCTTCTTGAAGATGGTTGGGACATCTTTGAGAAGGATATTGAACTTTAAGGTGGGGTTGGTGGCTTGGTGATGAAGGAAAG
GGCTGGTATTGAAATAGAAAACGCTATAACCTAGAGAATAAAATGGATTTGTGACCATGTTTGGATCAGGGATTGTATGAGCTTTTGATTCTCT
TGTGTGTTTGAAACCTAAACCAGATCACTTATGAGCTTTAATAGTACTACAGTATAGCTTTGTGCAAGATTTTT

Primers for UN06407 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 CTGCTGAGCTGTTGAATGGA 60.136 20 AATCCCTGATCCAAACATGG 59.605 20 273 1400 1672
2 TCCTGCTGAGCTGTTGAATG 60.136 20 AATCCCTGATCCAAACATGG 59.605 20 275 1398 1672
3 CTGCTGAGCTGTTGAATGGA 60.136 20 TCCCTGATCCAAACATGGTC 60.725 20 271 1400 1670