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Simple sequence repeat (SSR)
>UN82382
GTAATTGAGTTGTTATTAATATTTTAATGAACATTAGAATTTCAAAGTTTTCTAATAGCATATTTTTAAATAGCACATAAATTAAAGGTTAGTT
ATTAAATTTATATTGTGTATATAGTTATTTTTTTTACTTATATTGCTGGGAGTTTCAAAATAAATAAAATAATAATATGTAATTTATGTTAAGA
ATTTTTTTTCTTTTTTAAAAAAATATTACATTATTTTTCAAATTTTAACTCGTTTTAACAACCGGTGATATTTATTTATTTATTTATTTATTTA
AGTGAAAAGAACTTTGAAAAAGAAATTAGGTTGCTTTACTAATATATATAATTTGCTATATTTTTTTTATATAGCATATCTAATATAATAAACT
ATAGACTATAATAAGTTTTATAAAATATAGCATATAAATTTATTTTAATTAACATTAATTTATAATAATATTATATTGCTAATCACGAAATTAG
TTAATGTGTTATTTTATAAAAAAATATTTGAACTTTTTGATAAGATCTTGTTAGATTTTCTCAACAGATTTTCTATGAATATATGGAATGTTAT
AGTAAATCAATAATGATAAGATTAGAAAATAAATGTAACATGACTTTCTACGAATAGGTCCAACTTAAAAAATCACACATGAAACAAATTGTGA
CTTATGTTTTAATATATAAGATTTTTAATCGAATAACCTATTTAAAATCCGTTAACTAAAACTCGTATAATATATTTTTATAAATAATACTTCC
ATAATAATCTCAATTAAATAGTTTTAATAATATTAAATTTACTTCCAAAAATGTACTTTATAGACTTTGGTTAAGACTAAGAGGGGTGTATTGA
ATCATGGATTTTAGTGTTTTGATTTTGTTTTAAAATCTACTCTTATTTCACTAATGATTTC |
Primers for UN82382 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTGCTGGGAGTTTCAAAATAAA |
58.783 |
22 |
CCTAATTTCTTTTTCAAAGTTCTTTTC |
58.595 |
27 |
176 |
137 |
312 |
| 2 |
TGCTGGGAGTTTCAAAATAAA |
57.446 |
21 |
CCTAATTTCTTTTTCAAAGTTCTTTTC |
58.595 |
27 |
175 |
138 |
312 |
| 3 |
ACTTATATTGCTGGGAGTTTCAA |
57.074 |
23 |
AAAGCAACCTAATTTCTTTTTCAA |
57.773 |
24 |
190 |
130 |
319 |
|
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