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Simple sequence repeat (SSR)
>UN82938
AAGAAATTAGGTTTTTTATTTTTGTTATCGACAATTTATTAATAATGTTTTACTTCTGGTTTACTTTGGATTTGAAATTTAATTTTATTATTCA
CATTACACATATAAATATTTATGAATTTTTAAATTTTGATATTATTTGTTAGATGTCATAAATTAACTTGTTACAAAAAAAAATCTAAACTATT
TTTGATATTTTTTCTATCATGAATATAAATGCTATTACTTGTTATTGATAATATATATACAGCTTGATATTAGGCATGAAAAAATCAAAACATC
TAATGTATGAATTGTTTGCTGTCAATAATTGTAGTTGAATATTCTTGCTTTACATATATATAAAGCAAGAATATTCAACTACAATCATTGACAA
CTATTAATTTTGGAACATGACCAGTATATATGATGCTTTACAAAACATCATATATATATATATATATATAGTTAATGTATACGTAATTTTTTTT
ACAACAAAACAAAGGCATTCGAAATTGTAGGAAGTAGAGGAGAGGAGGTAGGAAGTATAGGCGTCATGGATCAGTTACATTATTTGATAGCTAT
GTAACCATACAATTATATAGGCGTGTAGCAATTGTATTTCTTTTTAAATTGGACCTAACCCATATCAATTGGTCATGTTCCAAAATTAATAGTA
TTGATACCCTCAAATAGAATAAAACAATTGGACAAAAACATTGCTTGATAAATTTTCAAAATAGCATTTACTAAAACATAAATGGATTTTTTCT
AATATTTGAGCTTAGGTTTATCTACTAAAATTTAGTATTTAGAAGGTCGGAGTTAGAGTAAAGTTTAGGATCTGTA |
Primers for UN82938 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
CAGCTTGATATTAGGCATGAAAAA |
59.677 |
24 |
CGAATGCCTTTGTTTTGTTG |
59.202 |
20 |
244 |
248 |
491 |
2 |
CAGCTTGATATTAGGCATGAAAAA |
59.677 |
24 |
CGAATGCCTTTGTTTTGTTGT |
60.025 |
21 |
244 |
248 |
491 |
3 |
CAGCTTGATATTAGGCATGAAAAA |
59.677 |
24 |
TTTCGAATGCCTTTGTTTTG |
58.792 |
20 |
247 |
248 |
494 |
|
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