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Simple sequence repeat (SSR)
>UN83012
GTGTGAATATAAAACTTCCACATGAAATTTTTATTGGGATATAAGTAATATATAAAAGGTTATAACTAATTTATTTATCAACAATTGATTCTAA
ATTAGAACTCTTTAATAAGTCTAAATTTTTATGATACCAAAATCTAAACAGACTCTGCTGAACCGAACTGAAATCAATTTACCATTGAAAAAAA
GTCCAGTTGATCCTAAACTGTACCATAACAATGATTTATGTTTGAAAACTGTACCATAACAATGAGACCACCGTATTTAAATTTGTTTTCTCAA
TGATACATACATACATATATATATATATATATGTTAACTATAAAACTTTAAAACCTATTATTATGTCATCTTTCTTTATTTTATAGGTTATTTT
GTATAGGTTAAAACGATTAGAAAAACTTATTTCAGGCATACAAAACACTTTTAAGAGCCTACACTTTGTTTTAACCTCGACAAACTAGGGCATC
AACAAGCCAGTCGACGGAAGAATATTAAATACTTCCTTCGTTTCGATTTAATTTTCGTTATAGGGAAAAATTTTCGTTTCAAAATAAATATTGT
TTTAGAGTTTTAATGCAAAATTTATTTAAAAGATTTTTTATTTTATTTTTCTATTGGTTAAAATGTGGTTAGATGTATAGCTAATTGTGTTTTT
ATCTTGGAAATATACAAAATCATATATTTTTCTTAATACCTAAAACGGCAATTAAAATGAATTGGAAAGATTATCTAACATGTGAAAAACTGGA
AAAATAGAATGTAGCTTAATGGTCCTGCTTCACCTGAGTTTAATTTTGGTACCGACTCCAAAACCAGATCGCACTATAGGCAAAAGTCTAAATT
CAAAGGTAGGCTATA |
Primers for UN83012 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CCATAACAATGAGACCACCG |
58.847 |
20 |
TATTCTTCCGTCGACTGGCT |
59.836 |
20 |
253 |
242 |
494 |
| 2 |
CCATAACAATGAGACCACCG |
58.847 |
20 |
TGCCCTAGTTTGTCGAGGTT |
59.734 |
20 |
227 |
242 |
468 |
| 3 |
CCATAACAATGAGACCACCGT |
59.726 |
21 |
TATTCTTCCGTCGACTGGCT |
59.836 |
20 |
253 |
242 |
494 |
|
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