 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN00674
GTCACAACTCATAATATATATAGATAGACACAAGTGAAAAGTGTTTTACATGTAGCCACAACACCAGATCATATAAAGGTAAGTCTCAACACCA
AATTGAAAAGCGAAAACATAATTAGAAGATGATAATAGTCTTATGCCAAACACACACAATAAAAGACAAGCTTCCACATCATTAGGACAATTTC
TCAGTCATTCCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTTTCATTCTCATTCTCATTCTCATTCTCATTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTT
CTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTGTCATTCTCATTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC
TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCTCCATCAACCTCCTCGACAACAGCGACTCCACCAGCAGCATTGAGCTTCGCTG
CAAGGTCTTCAACTTCTTCCTTTGTGATATATTGTTTAACAATGGAAGGGACATTTTCAGCAATCTCATAACTATCGCCCATGTAAAACTGGTA
CAATGATGTCTTGTCTTCGGTAGTTTGGGCCCATGCAACTTCTTTAAGCACACCATTATAATAAGGCTTTTCACACTCCATCAACTTCACAAGA
AACCTCTGATCTGCTCTTCTTGGAGTTTTGGGAGGGGTTGGAAGTCCCAACGCTT |
Primers for UN00674 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
| 1 |
CATTCCTCCTTCTCCTTCTCC |
59.266 |
21 |
TGTTGTCGAGGAGGTTGATG |
59.676 |
20 |
246 |
194 |
439 |
| 2 |
TCCTCCTTCTCCTTCTCCTTC |
59.008 |
21 |
TGTTGTCGAGGAGGTTGATG |
59.676 |
20 |
243 |
197 |
439 |
| 3 |
TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC |
59.008 |
21 |
TGTTGTCGAGGAGGTTGATG |
59.676 |
20 |
240 |
200 |
439 |
|
|