 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN07348
AGAAGAAAAAAAAAATAGATTCCTCGTAACTTCTCCTTCACCGATCACTCTTTCTCTCTCTCCGCCGTTGTTTCACGCCGACGAACTTGATCTC
CGATTTATCCATAGTTTCTCTACAGACGTAACCTTCGTTATGGATCCGTCGCACCAGCGTGTTGAGCAGCCTCAGGTAACTCCTCCTCACGATA
ACGAGGTTACTGAATCGCGTGGTGTGGTTGTTATGGAATTATAATCGGAATCTGGAAGCTGTTTTGTTGAGAATATATATCATGATGATAGTGA
TATTGATGCGAACAGCCTCAGTGATTTTGATGAACTCGATGACGATTCTGGGATTCGATTTCGCGATATCAGTGAGATCCGGTTAATTTCGGTC
GAATCGGGTTCTGATGACGATCCTGAGGATGAGAGGGAGATATGGGGCATCGATTTGAACGAAGACCATGTATATGATGATGATGATGATGATG
ATGATAATGATGATGATGTTAGTGTGACTATACATTCACTCCAAGTAGAGGATCGTGCTGATGAATTTGATTGGGAAGAAGTTGGTGGTGAAAG
GGAGATACGAAGCGGTTTCGCAGAAGCTAACATCTCTCTAGAAGATTTAGCTAGAGATGATGACTCTGGGAATCTTGAGTGGCAAGTTTTGATG
AACTCTCATACTCTAGAGATCAACTTCGATGTGGAAAACAGAGAGCTGCACATCGTTGGTGATCATGAAGATTACATTCACACGGCTGAGTATG
ATCTCTTGTTTGAACAGTTTGCTCAAGCTGGGATCACCAATCTCCGTTTCCCTCCAACTTCCGTATCTTTCATCAAGAACCTCCCAGTGGTTGT
TCAGCTTGATGTTGAGGATGGTGACTGTGCGGTTTGTAAAGATGAGATGAGCATCGGGAGCGAAGCTGTTCTTCAGTTGCCTTGTAACCATAAG
TACCATGGAGAATGCATTGTACCGTGGCTCGAAACGAGGAACACGTGTCCTGTTTGTCGTTATGAGTTGCCTACGGATGATGTAGACTATGAGC
GAAGGAAGAGACATATAAGGAGATTGTGATGCTGTATGGTAAATGGGTTGGTTAACATCCTCTATATATGGTTTTTGTCTTTTGAATATTGAAG
CTTGTGTGTGTATTAGTATGTTTGTATTGAGTCAAGCTTTTTCTTAATTTATATTTGTATTAGCCTCATTGTGTGATCCATGTGATGGTGTAGG
CTTGAGGAGGTTAGCTTTATGTAGAGGAACATGTGTGTATATTATTGTTTGCTTGGACAAGGTTTATACATGTATGCATCCTTGAGCAAAG |
Primers for UN07348 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CTCGATGACGATTCTGGGAT |
60.034 |
20 |
TTCACCACCAACTTCTTCCC |
59.943 |
20 |
246 |
317 |
562 |
| 2 |
CTCGATGACGATTCTGGGAT |
60.034 |
20 |
TCCCTTTCACCACCAACTTC |
59.943 |
20 |
251 |
317 |
567 |
| 3 |
CTCGATGACGATTCTGGGAT |
60.034 |
20 |
ACCGCTTCGTATCTCCCTTT |
60.096 |
20 |
264 |
317 |
580 |
|
|
