|
Simple sequence repeat (SSR)
>UN07751
GGCAGTCCAAAGGTTGACCCCACATAATATCATAGATAGAGAGATGCAATAACCGACAAGAACAAAGATGAAGACAGCATTTTCCAACACAGAG
GCTTAAAACAAACTGACCATATACAAACACATGTGTACGTAGGTGACGAGAGAGAGACTGTACATACATGTGTTTATATGTGTTCACTAATAAT
GTATAAGGACGAACTTTATATGTAATAGTAACCTTTTTTCCACAAACTCCCGACTACAACCTGAAGAAGAACTAGCAACGTTTATGTTTTCCTC
GATTAAACAAAGACGATGCCATATTTCTAAAACGTATTAAATGTAACATATCACAAACTCCTATACTATATAGTGTAGAATATATATGATATGG
AAAAGAGTTATCAACACATGTGAGTGATTATTTATGTCCTCTCCTTCCTCCTTATATATAGATATAAAAACGTATATAAATTCTATATATTTAT
ATGTTTATTACGTACTCATGTCTGGGAATCCCATGTTGATAGAGATGACTAGGGTTTGCTTAAGTGATGACGTACTGTCCACAAGAGATTGGCG
ATGAAGAGGATGATGATGAGGGAATGATCATGTGATTAATGTATGAGTCCACTCGTCGATGATCACCAGGCATTTCCAAGTTGTACGTTGTTGG
GAGAAGAAAGCTGCCGTGGTCTTGTGAAATTGCTTTGCCTTCAAGAACTTGTCCACATATTAACTTTGTGGTCACCAAAGGAAAGCTCCGAGGA
TCACCATTATCATTGTATGGTGTTACAAACACGTTGAGTTTATCACCATCATCATAATCTTGAAGGTTGTCGTGAAAAGTGGAAATGGTACTCG
CTGGGAGATCTGGTAGCGATGGCCACTGGGGGTCATTATCATGATGGTGATGATGGTTGTTGATGAATGGTGTGGCTGACAAAATGTCGAGGTT
GGTGTAAAGGTTATTATCTTGATGAGACTGGTTTGTGTTGGTAGCGGTTAAATACTTGATATCTCCTTCTCTAGAGGTTGAGAACATCAATGGA
GACATAACATGATGAGAAGGAAGAGGGAGATGGGTTGGAGTGATGAAATTAGGGTTAGTGTTTGTGATGATACTGGACATGAATCTTGAACCTT
CATCGTCGCCAGCAGTAGCGTTGAACACGTTGTGATAAGGAAGGTTAGTGAGCAAACTCGCCATTGAAGAGGTATGATGATGATGATGACCATG
ATGATGGTGATAGTGGTGAGACATGAGCTTCTTTTTAATGCTTGAGTTCCAGAAATTCTTGACCTCGTTATCTGTTCTTCCAGGTAGATGTTTA
GCAATTTGTGCCCACCTGTTACCAAGAATGCTATGAAGCTCAATGATAAGAGCAGCTTCTTGAGGTGAGAAGCTTCCACGTTTAAGATCAGGTC
TTAGATAATTTATCCATCTTAATCGACAACTCTTTCCACATCTCTGCAGACCTGCATGTTTGGGAACAGAGCTCCAGCATCCATGGCCATATGT
ATTGATGTAGTTGATGAGCTTTTCGTCTTCTTCCGGTGACCAAAGCCCTCTCTTCACCTTTTGCTTGTTGCAGCACGAGTGATGGCCCATCTCT
CTTTCTCTCACTAGTTATTCTCTCTCTTTTCTCTCTATTTCTCTCACTAAGAATGTTTCCC |
Primers for UN07751 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
AGAGGGAGATGGGTTGGAGT |
59.929 |
20 |
TGGGCACAAATTGCTAAACA |
60.111 |
20 |
275 |
1056 |
1330 |
2 |
GGAGATGGGTTGGAGTGATG |
60.326 |
20 |
TGGGCACAAATTGCTAAACA |
60.111 |
20 |
271 |
1060 |
1330 |
3 |
AAGAGGGAGATGGGTTGGAG |
60.447 |
20 |
TGGGCACAAATTGCTAAACA |
60.111 |
20 |
276 |
1055 |
1330 |
|
|