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Simple sequence repeat (SSR)
>UN08124
GTATCACAAAGCTCTTTTTTTTGTCATCCACATCACAAAGCTCTACACATTGCCACTTATAAAAATCACGAAATCATAGAAGCACATGAAACCA
AAAGAGTTGTCACACTCTTATCTACTACATAAATAAAACAACCCCGCGCTTGCGCGGGGGGGGACTGCCACTAGTTCACACAGAAACTAACTTA
ATTCCAAATTTTTTTAAAAAAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGCTTACCTAATTACAAACAAACACAATTAAGCTTCCTCTCAAACAGATTTTAA
TAAATAAATTAAGAAATACAAAAATTTGTGAAGAATGGATCTCGTGAAAACTCTTTACCTTGACGATCCACGAAGAAACACAGAGAGAGCAGAG
AAGAGAATAATTCGTTTTTTTCTCTTTAACCTTCCTCCTTTGCTTTTTTGCTTCCTTCTATCCAATCACATCCATCGCAGAATATTTAATTCCC
CAAATTAAATAAACAAAAAAAAGTGAATCGGTGTTTTGAATTTTTTTTGTTTTTCTCGAATTCTCTCCCTCCTCTCACGACGCGTTGTTTCCAG
CGAATAATCCGTGCGGCCGGCGGTAACTACGGCGGTTCCGGCGAGACTCTGCCGGACGACGACGTGCGATCCCGGCAGAGAGAGAGAGAAGGAG
AGAGTTTATTTTAGGTTTTTTTTTAATTTTCGGTTAGTTTGGTTTAGAGAGAAAAAAAAAGAGCGGACAAAAAAAAGAATTAGAGTATGGAGAA
GGGGAGGACTCTGCTGCGTCTGTATGTACCGTGGACCTAGTGGAGCTGTACGATCTTAACCGTAGGATTAATGATTGATTCCTTAATAGTTTGT
TTTTTTAAATAAAAAGGAGGAAAATAAAATATTACGGAGTTACACGAGAGTCTTGACGGCAGACGACGAGTTCGGCTAATAACTGGGAGCCGGC
TACTGAACATTTTAAACTATTTGGTGTTCATTTTTCTCTCCAAGTGTAACTATTTTTTTTCAAATGTAACTACTTTTAAATAATACAAACTATT
TATCAAAATGTACAAATCAAGTTAGGAATCTACATATTATCACTTGTCAATACTTGTTTTAGATGATATTAAACAGAATGAGAGTTCAGTGTGC
CAGATAAAAATATTTTTACAGCATCTTAGCTATGTTTAAATATTCAATTGCTAAGATATTAGTATTTTTTAGTGTCATATCATTAACATGTAGT
TAAATATACATCTAACTAGTGATGG |
Primers for UN08124 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GGGGACTGCCACTAGTTCAC |
59.579 |
20 |
TGTTTCTTCGTGGATCGTCA |
60.24 |
20 |
209 |
154 |
362 |
| 2 |
GGGGACTGCCACTAGTTCAC |
59.579 |
20 |
TCTTCGTGGATCGTCAAGGT |
60.656 |
20 |
205 |
154 |
358 |
| 3 |
GGGGACTGCCACTAGTTCAC |
59.579 |
20 |
CTGTGTTTCTTCGTGGATCG |
59.288 |
20 |
212 |
154 |
365 |
|
|
