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Simple sequence repeat (SSR)
>UN08124
GTATCACAAAGCTCTTTTTTTTGTCATCCACATCACAAAGCTCTACACATTGCCACTTATAAAAATCACGAAATCATAGAAGCACATGAAACCA
AAAGAGTTGTCACACTCTTATCTACTACATAAATAAAACAACCCCGCGCTTGCGCGGGGGGGGACTGCCACTAGTTCACACAGAAACTAACTTA
ATTCCAAATTTTTTTAAAAAAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGCTTACCTAATTACAAACAAACACAATTAAGCTTCCTCTCAAACAGATTTTAA
TAAATAAATTAAGAAATACAAAAATTTGTGAAGAATGGATCTCGTGAAAACTCTTTACCTTGACGATCCACGAAGAAACACAGAGAGAGCAGAG
AAGAGAATAATTCGTTTTTTTCTCTTTAACCTTCCTCCTTTGCTTTTTTGCTTCCTTCTATCCAATCACATCCATCGCAGAATATTTAATTCCC
CAAATTAAATAAACAAAAAAAAGTGAATCGGTGTTTTGAATTTTTTTTGTTTTTCTCGAATTCTCTCCCTCCTCTCACGACGCGTTGTTTCCAG
CGAATAATCCGTGCGGCCGGCGGTAACTACGGCGGTTCCGGCGAGACTCTGCCGGACGACGACGTGCGATCCCGGCAGAGAGAGAGAGAAGGAG
AGAGTTTATTTTAGGTTTTTTTTTAATTTTCGGTTAGTTTGGTTTAGAGAGAAAAAAAAAGAGCGGACAAAAAAAAGAATTAGAGTATGGAGAA
GGGGAGGACTCTGCTGCGTCTGTATGTACCGTGGACCTAGTGGAGCTGTACGATCTTAACCGTAGGATTAATGATTGATTCCTTAATAGTTTGT
TTTTTTAAATAAAAAGGAGGAAAATAAAATATTACGGAGTTACACGAGAGTCTTGACGGCAGACGACGAGTTCGGCTAATAACTGGGAGCCGGC
TACTGAACATTTTAAACTATTTGGTGTTCATTTTTCTCTCCAAGTGTAACTATTTTTTTTCAAATGTAACTACTTTTAAATAATACAAACTATT
TATCAAAATGTACAAATCAAGTTAGGAATCTACATATTATCACTTGTCAATACTTGTTTTAGATGATATTAAACAGAATGAGAGTTCAGTGTGC
CAGATAAAAATATTTTTACAGCATCTTAGCTATGTTTAAATATTCAATTGCTAAGATATTAGTATTTTTTAGTGTCATATCATTAACATGTAGT
TAAATATACATCTAACTAGTGATGG |
Primers for UN08124 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTCTCTCCCTCCTCTCACGA |
60.064 |
20 |
AGCAGAGTCCTCCCCTTCTC |
59.952 |
20 |
237 |
531 |
767 |
| 2 |
TTCTCTCCCTCCTCTCACGA |
60.064 |
20 |
GCTCCACTAGGTCCACGGTA |
60.134 |
20 |
268 |
531 |
798 |
| 3 |
TTCTCTCCCTCCTCTCACGA |
60.064 |
20 |
ACAGCTCCACTAGGTCCACG |
60.321 |
20 |
271 |
531 |
801 |
|
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