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Simple sequence repeat (SSR)
>UN08380
CATGTTATCGTCTCTGCACCAACTTCAACGCATAAACACGACAAAGGCTTCCCCTATCCTGTCGAACATTCGCAAATTCTAGAGATGGACGTTG
CGGGTGGCTAAATCTCCTTCTCCAGCTTGACCTTTAATTAGATGCGTCTGAGAAGAAACAACATTACTTTAACACCAATCTTAGATCCTAACTT
TTGTAGAAGCGAAGCCATTGGTATGGAATATGAACTAGATTGTGCTGGACAACATCATCATCATCATCATTTATCAGCTGTCTCTACAACCGCT
ACATTATTCATTCCTTTATCTTTGAAAATCCATATTCGTGACGGCTTTCACGAGATTCTTTAATACCATTTTCATACACACACAAAAAGAAAAC
TTACTTTAGTTAAAAATTTAAATTGTTCAGAAGATTAGTCAGAAATGCAGGCTTTTGTAAGTGGGAAGAAAAGAGTTGTATTAAATCACAACAT
GTGTTTCTCCAAAGACAATCTTGATGTTAGTACAGAGTTCTTGTCTGATAATTACCGGGACGACCCTTTGATCCCGGGCTTGTCTGATGACGTC
GCGAAGATGTGTCTAGCGCTTGTTCCGCGTAGTAGCTTTCCTTCCATGGGACGTGTCTGCAAGAAATGGAGGTATGTTGTGAAGAGCAAAGAGT
TCATTACTGTGAGAAGACTTGCCGGTATGCCTGAGGAGTGGCTCTATGTTTTAACAACGAAATCTGGAGGGAAAGATAGCCACTGGGAGGTGTT
GGACTGTCAGGGACATAAACTATCATCTCTTCCACCTATGCCTGGTCCTGCCAAAACAGGGTTTAAGGTGGTTGTGGTTGATGGGAAGCTCCTT
GTCGTTGCTGGTTGCGCCTTGATCAACGCTTCTCTTGTTGCATCTTCTGATGTTTATCAGTTTGATACTTGCCTCAACAGCTGGAGTAGACTAG
AAGACTTGAAGGAAGCACGCTATGACTTCGCTTGCGCTGAGGTGAATGGGCTTGTTTACGTGGTGGGAGGTCACGGTGTTGACGGTGAGAGTCT
GTCGAGTGCAGAGGTGTATGATCCAGAGACTGGTGTCTGGACTTGCATAGAGTCTCTGAGGCGTCCGAGATGGGGATGTTTCGCTAGCGGCTTC
AACGGGAAGCTATACGTGATGGGTGGGAGATCTAACTTTACTATTGGTAACTCTAAACTTGTTGATGTGTATAACCCTCAGTGCGGCTCCTGGT
CTGGCAGCAAAAACGGTTTAACTATGGTGACAGCTCATGTTGAAGTAGGAAAGAAGCTGTTCTGTATTGATTGGAAGAACCAGAGGAAGATGTC
AGTCTTCAATGCAGAAGATGAAACTTGGGAAGTGGTGGCTCTTCCGCTTTCGGGAAGCTCCAGGGCAGGGTTCCAGTTTGGTAAGCTGAGTGGG
AAGCTTCTGCTTTTTTCGTCTCAGGGAGAAACTGGTCACAGCACTTTACTGTATGACCCTGATGCTGCACCAGGCAAACAGTGGAAAACATCCG
AGATAAAACTGTCCGGTCCGTGCGTATGCAGCGTAACAATCACAGCCTGATTAATGTGGTCTTTATTACATTTTCGCCATTTTCCAAATCAAAG
AGAGCATTGTCTCTTCTATAAGTTGATACAGTACTGATTTCAAATACTCAGTTTGAATAAAGTGAAGAGTGTTTTCTTTGAAACTGCTTTAGCG
TTCTTGTGGTGTTCCTCCACTGTTTGTTCCTTGTAACATATGATTGTGTTGACTTATGTTTAATTTGTGATTGTAATTTCCTAAACGATGTTTG
AGGTAATATTTGGAATTGCTCAAA |
Primers for UN08380 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CGAAGCCATTGGTATGGAAT |
59.784 |
20 |
GCCGTCACGAATATGGATTT |
59.791 |
20 |
130 |
198 |
327 |
| 2 |
CGAAGCCATTGGTATGGAAT |
59.784 |
20 |
TGAAAGCCGTCACGAATATG |
59.688 |
20 |
135 |
198 |
332 |
| 3 |
TCTCCTTCTCCAGCTTGACC |
59.53 |
20 |
GCCGTCACGAATATGGATTT |
59.791 |
20 |
221 |
107 |
327 |
|
|
