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Simple sequence repeat (SSR)
>UN08871
GGGTCACAGATCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTATCTCTCTCAGACGTGAATCTCACACATACATGTTTCTCTGTCTCACTCTCCTAATC
TCTCTCCCACATACATGTTTCTCGCTCTCTTTCCTAACTCCAAATCTCGATTGATACCTTGATTTTTTTTTTTTTGTATTCTTTACAGGAAGCT
TATTAGCAAGGAGCTTTCTGTTCTGTTCGGATTCAACGATAGAATGTTGGAACCCCTAATCCCTCTCTGCTTTGGCGTTGTCTCTCTGTCTCTC
TCTCTCTCACCATCTCTCGATCACTGAAGCAAGTTTTCTACTTTGGCATCTCTCAGCTCTTAGTTAAAGAAGGCGGAGAAGGCTGAAGAAGCTT
GATGGTGGTGGTTTCGGAGTCAACTGTGGTGGTCTCGACGTCTACAACGGTGGCTGAGCGCGGTGGAGGAGACTGATGAAGCTTTACCGTGGTG
GTCGTGGCTGGCGGCGAATAGTGGTGTAGAGATAGGGCTAATTTTTTTTAAGGTTAAACCGGTTTAGTTTTTTAGATTTCTAAACTAGGTTTAC
GTGTAAACCTTAGGTTAATTATGGTTTGGTTTAATGTTTGTAATTAGTTTTTGGTTTAATGTGTTCTTTAATTATTTGTATACTGATTTTAATC
AATAAATAAAATTTAATTTTT |
Primers for UN08871 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
ATGTTGGAACCCCTAATCCC |
59.881 |
20 |
CACCACAGTTGACTCCGAAA |
59.72 |
20 |
176 |
232 |
407 |
| 2 |
ATGTTGGAACCCCTAATCCC |
59.881 |
20 |
CACAGTTGACTCCGAAACCA |
59.72 |
20 |
173 |
232 |
404 |
| 3 |
ATGTTGGAACCCCTAATCCC |
59.881 |
20 |
GTCGAGACCACCACAGTTGA |
59.712 |
20 |
184 |
232 |
415 |
|
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