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Simple sequence repeat (SSR)
>UN09616
GATACGAGCGAGTCGCCGGTTTCGCATCGCTTCAGGACTCAGGAGTCAGAACTCATAAGCACCAAACTCAGCCCCAATGTCTCACTGAGTCCAC
CCGGGGTGCTTCGTATTCCAAGTTCTATCTTGTTCCGTCGTCCTCTCGTATTTTCGTTTCTAATTGTGATGCAATCGTTGCAGAAACCCTAATT
TCGGAGGGTTGTGTAAAAAGTAGCAATGGTTAAAAACGCAATTAGTGATGGTGAGTGGACAGTTGTGTTACCTAGTAAACGAAGACATGGGAAA
ATAAAACCTAAACCTAAGATTCATGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAGCCATGGAAGTCTGATGATCTTGAAGTTGATCTGCAGAGGCAAGCAAGAG
TAAAGCAGAAGATGGAAAACTCTATCAAGAAAGTCGAGAGCTCAAAATTCTACGCAGCATTCTTAGAACGGCTCAAATGCCCCGAGGTTTCGGA
CCAGTTTCGCCTCGTGTTAGGTGGCGAAACACAGCTTCAGATGGTGATGTACGGTATAGGAAGCATCGAGTCCTACGAGTCTCCAAGGTTTCAG
CTCAGCGTTGCAATCTTGATGAAGAGGGAGTTTGAATGGGTCGGTAACATTGAAGTGTTCGATCCGGTCCTCTCGGCGACTGAATCTAGTGTCC
TGGAATCTCTGGGGTGTACTGTTTTGTCTGTGAACGAGCAAGGTCGTAGGGAAGCTTTGAAGCCTACTCTTTTCTTCATGCCACACTGTGAGGC
TAATCTGTATAGCAACCTGTTGCAAGCGAACTGGAGGATGGATCGGTTGCGCAGGATTGCATTGTTTGGGAACAGCTTTCAGATGTATGAGGAG
CAGGTGACGTTTAAACCGAATGTCATCCGTGCTACCAAACGGATCATAGCTGCACGGGGATTCACTAGTGAGTTTGCTATTGAGACTGTATCTG
ATGATTATTTTCCAGCGTTCCATGATTCGAGCTGGCATTTTTTTAGCCCCGGTTTAGATTCGGAGCTGCCATTGTTGGTTTCAGAGGGATTATA
GGTCATTGCTTTTTTGCATTTGTCAGGTCTTTGTGTTTGCTATCTGTTCTAAGTTTAACCATTGAAGTTGTTGATTTATCATTGGTTTAATATT
TGCTTGAAACAATGAAATATGTTATCACAAATTTTCATAATCTCTTCAGTAAGTTGTATTTAGTTTTCACAGTAAGTTGTTGTTCTTGATTTGG
ATTTGTGTTTGTTGTGACTCAAGTTGTGGTAATCAGTTGGTATAATTGCAATTTGTCTGTTTCC |
Primers for UN09616 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CCCTAATTTCGGAGGGTTGT |
60.18 |
20 |
GGCATTTGAGCCGTTCTAAG |
59.845 |
20 |
277 |
181 |
457 |
| 2 |
ACCCTAATTTCGGAGGGTTG |
60.18 |
20 |
GGCATTTGAGCCGTTCTAAG |
59.845 |
20 |
278 |
180 |
457 |
| 3 |
ACCCTAATTTCGGAGGGTTG |
60.18 |
20 |
AGCCGTTCTAAGAATGCTGC |
59.62 |
20 |
270 |
180 |
449 |
|
|
