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Simple sequence repeat (SSR)
>UN09796
GGACATTACATCAACCCTTTGTGCAAGCATACTCTATGGAATCGTGACCACCAAGCTAATAGATTAGTTGGCGGAATGTGGTCGTCGTCTTTGG
TTCTGGAGAGGGGTCGTAAGGAGACGAGGGATTTTGGTGGTGTTAAGGAAGAAGATTCTTGGATAGATTTGTATTTACCAGAAAGAGCTAGAGG
TTATGCTAAGCTTGCTCGTTTTGATAAACCTATTGGTACTTGGTTGCTTGCTTGGCCTTGTATGTGGTCAATTGCGTTGGCTGCTGATCCTGGG
AGCCTTCCAAGTTTTAAAATGATGGGTTTGTTTGGTTGCGGAGCTATACTTCTTAGAGGTGCTGGCTGTACTATTAATGATCTGCTTGATCAGG
ACATTGATACAAAGGTTGATCGTACAAGATTAAGACCTATAGCCAGTGGTCTTTTGACACCATTCCAAGGGCTTAAATTTCTAGTGTTATAGTT
GCTTTTAGGCTTAGGGATTCTTCTCCAACTTAACAATTACAGGTTTAATTTTGTTTTGAAGATTATAAAACCTTCCCTTTGGTTTTTGTGATTG
AGTTACTTAGCTCATCTCTTCTGCAGCCGTGTGTTAGGGGCTTCCTCTTTGTTCCTTGTTTTCTCCTACCCACTTATGAAGAGGTTACATTTTG
GCCTCAAGCATTTTTAGGGTTGACCATAAACTGGGGAGCATTGTTAGGATGGGCTGCAGTTAAAGGAAGCGTAGAGACAGCTGTTGTACTCCCT
CTTTATCTCTCAGGAATCTGCTGGACCCTTGTTTATGATACTATTTATGCACATCAGGATAAAGATGATGATGTGAAGGTTGGTGTTAAGTCGA
CGGCTCTTAGGTTCGGTGAGAATACAAAGCTTTGGCTCACTGGGTTTGGCACAGCATCAATGGGGTTGCTTGTACTTTCTGGACTGAGTGCAGA
TCTTGGGTGGCAATACTACGCATCGCTGGTGGCTGCATTGGGACAGTTAGGATGGCAAATAGGGACAGCTGACTTATCATCTGGCGCTGACTGT
AGTAGAAAATTTGTGTCAAACAAGTGGTTTGGTGCTATTATATTTAGCGGAGTTGTACTTGGAAGAACTTTTCAATAGAGATCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTTGATGAAGCTGTTCCGAGAGTATACAGAGTAAAGCTGTTCCTTCAGGATCCGAAAAGCTATTGTCAGATATAAGCT
GAAAAACTTTGACTCTTCTCTTCTGTTAATAAGGACTCTTGTTTTGGGATTTCACGTCTTTGTTCATATTGTCGACCAAGTAAACCTTCTAGCC
AGACTAGAGGCTTTACGCTTTTGGCTTCTATAAATAGTTAACATACGTAACAGTATCAATTATTTGTAAACTACAGTGACTAAATCCCAGTAGT
AATTTTATTTTAATTTCAATCTCAAAAATGCAAAAGATTGAATTGGTCGTCTCATTGTAAGGATAACACATAAATATAAAGATTTAACATTTTT
CTCATTCATTC |
Primers for UN09796 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TGACTTATCATCTGGCGCTG |
59.972 |
20 |
TGAACAAAGACGTGAAATCCC |
59.963 |
21 |
279 |
1010 |
1288 |
| 2 |
TTATCATCTGGCGCTGACTG |
59.972 |
20 |
TGAACAAAGACGTGAAATCCC |
59.963 |
21 |
275 |
1014 |
1288 |
| 3 |
TGACTTATCATCTGGCGCTG |
59.972 |
20 |
GAACAAAGACGTGAAATCCCA |
59.963 |
21 |
278 |
1010 |
1287 |
|
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