Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN00120
GGCTCTCTCACTACTTTGCGCTTGTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTCGAACTTTGGTTTTTGCTCTGTTTATTCACCAATGGCTACTGTGTGGAGA
AGGTTGATCAAGAGAGAGACGATCCCTCGTATCAGCCAAAGCACGAGGAAGCTCTTCTCCACCGAAGCATCTTCTTCTTTCGCTGAGAGACTCA
GAAACCTTCCCAAAGATTTCCCCTCCACTCAGGCTAAACGCGATGCTTCTCTGCTCATTGGAAGAACTCCTCTCGTGTTTCTCAACAGAGTCAC
TGAAGGATGTGAAGCTTATATTGCAGCCAAGCAAGAACATTTCCAGCCTACTTGTAGCATCAAGGACAGACCAGCTTTAGCTATGGTTGCAGAT
GCAGAGAAGAAAAATCTTATCACTCCTGGAAAAACAACATTGATAGAACCTACTTCAGGAAACATGGGAATAAGTATGGCTTTCATGGCGGCTA
TGAAAGGGTACAGGATTATAATGACAATGCCTTCTTACACCAGTTTGGAGAGGAGAGTGACTATGAGATCATTTGGTGCTGAGCTTGTCCTCAC
TGATCCAACCAAAGGAATGGGTGGAACCGTTAAGAAAGCTTATGATCTCCTTGAGAGTACTCCTGATGCTCACATGTTGCAACAGTTTGCTAAT
CCAGCAAACACTCAGATTCATTTTGATACAACTGGTCCTGAGATTTGGGAAGATACACTTGGGAATGTTGATATCTTTGTGATGGGAATTGGTA
GTGGGGGCACTGTCTCTGGTGTTGGCCAATACCTTAAGTCTAAAAACCCTAATGTCAAGATATATGGAGTGGAGCCTGCTGAAAGCAACATACT
CAACGGTGGCAAGCCAGGTCCACATGCTATCACAGGCAATGGGGTTGGATTTAAACCGGATATATTGGATATGGATGTTATGGAGAGTGTTCTT
GAGGTTAGTAGTGAGGATGCTATAAAGATGGCTAGAGAATTGGCATTGAAAGAAGGTCTCATGGTTGGAATATCCTCTGGGGCTAACACTGTGG
CAGCAATTAGACTGGCCAAAATGCCAGAGAACAAAGGCAAACTAATTGTGACTATTCATGCGAGCTTTGGAGAGAGATATCTGTCATCTGTTCT
GTTTGATGAGATTAGGAAAGAAGCAGAAGCGATGAAGCCAGTTTCAGTGGACTGATTTGGTTTTGGTTTGGGTTGATATGAAGAAAAACTCTTT
ACTATATAATCTTCATCTTGCGGCACAAGATTGTGACACAACCCACCAAAAAGTGTCATAAATAATATATGCTTGTTTTATATTGATGTTGAAT
ACTGGAAGAATAATTATGTTAATGTTTGATATTGAAAATAAAAGCTTTTTCTGGTT

Primers for UN00120 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 GCTCTCTCACTACTTTGCGCT 59.046 21 AGATGCTTCGGTGGAGAAGA 59.95 20 165 2 166
2 GCTCTCTCACTACTTTGCGCT 59.046 21 GATGCTTCGGTGGAGAAGAG 59.95 20 164 2 165
3 GCTCTCTCACTACTTTGCGCT 59.046 21 AGAAGATGCTTCGGTGGAGA 59.95 20 168 2 169