|
Simple sequence repeat (SSR)
>UN10316
GCAAGGTTATGAGGGATCCTAGTGGTGCTAGCAAAGGATCAGGGTTTGTTGCCTTCTCTGCTGCTAGTGAAGCTTCTAGAGTGCTGAATGAAAT
GAATGGTAAAATGGTTAGTGGCAAACCGTTGTATGTTGCTCTAGCACAAAGGAAGGAAGAAAGAAGGGCTAAGCTGCAGGCACAGTTTTCTCAG
ATGAGACCTGCTTTTATCCCCGGTATGGGTCCTCGTATGCCAATGTTCCCAGGCGGTGCTCCAGGTCTTGGACAACCGATGTTTTATGGTCAAG
GACCTCCACAAATGATCCCTCACCAGACTGGATTTGGATATCAGCCTCAGATGGTTCCTGGCATGAGGCCAGGCTATTTCGGCCCGATGATGCA
GCCAGGTCAGCAAGGGCCACGACCAGGTGGAAGACGGTCAGGTGATGGACCTATGCGCCACCAGCCTCAGCAACCAATGCCATATATGCAGCCA
CAGATGATGGCAGGAGGACGTGGACACCGTTACCCTCGTGGTAGAAACATGCAAGACGGTCCAATGCCTGGAGGAATGGTTCCATTTCCTTATG
ACATTAATGGAGTGCCTCTTATGCCTGCTGGTGCATTGGCTTCTTCCCTTGCTCAAGCCTCACCTGCTCACCAAAGAACTATCCTGGGTGAGAC
TCTGTACCCATTAGTGAACAAGATAGAGCACGAGAATGCTGCCAAAGTGACGGGTATGCTTTTGGAGATGGATCAGACAGAAGTGTTGCATCTG
ATAGAGTCACCAGAGGCTCTAAATGCTAAAGTTTCAGAGGCGTTGGATGTGTTGAGAAACGTGAATCAGCCTAGTGAAGGCAAGAGTGGTAGCC
CAAGTGATATGATGGCTTCACTTTCGATTAATGATCACTTGTGAGAAGCTTTTGTCTTTGAGTACTGCTTTGAACTCTCTTTCTCTCTCTCTCT
CTCTGATTGACAAAATTTTTGCGGAATGGTTGTTTTCTGTTTTGACTTGAATTGATGCTTTTTTGGTTGGATAATCTTTTTTTTTGCTATTGCA
ATTACAACTTTGCGACTGGTAAAAAGGCTTTTTATTATTC |
Primers for UN10316 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
AGTGACGGGTATGCTTTTGG |
59.993 |
20 |
ACAGAAAACAACCATTCCGC |
59.978 |
20 |
277 |
704 |
980 |
2 |
GACGGGTATGCTTTTGGAGA |
60.074 |
20 |
ACAGAAAACAACCATTCCGC |
59.978 |
20 |
274 |
707 |
980 |
3 |
GCCCAAGTGATATGATGGCT |
59.923 |
20 |
ACAGAAAACAACCATTCCGC |
59.978 |
20 |
137 |
844 |
980 |
|
|