Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN11213
AAACCACAAGCTGTGCTACTACTACTCGTACAACTACTACTTATTAAGTGATTGATCTCCTCCATTCCATAATCTTGCATTGATCTCTCTTCAT
GATGATGATCATGTTGTTCCATCTTCCCTCTTGTTACTGTACTTGTTGTGCTTGACCCACTTCTTACATCACTCAACAACATTATTCCTTTGTT
TGTACTTTGCGCATGGCTGTCTTCTTGATGGCTCATTATAAGCTTGTTGCTATTTGGAGAATTTACCAAACTGTCCATGGCTTCTTTGTATAAT
AGTTGTTGTTGTTGGTCCATCATTGTCATCATCATCTCCTGATGAGGTGAGAGATGAGGTGAGATCAGCTGGTTTGTAGATATTGTTGGGTTAT
ACGGAGGAAGATTATTGGTCATGTTGTAGTGTGATGATGATGGTGATGATGATGATGAGGCAATGGCTACGAGTTGATGAGGTGGTGGAGGAGC
CATAGTGGCAATGAGCTTCTTCTTGAGCTTAGTGTTCCAATGGAGGCAAAGAGGCTGCAGATAATATTGTCTTCTTCCTCAGAGAAATCTCCAT
GTCTTATGTTTGGCCTCAAATAGTTTAACCACCTCAGTCTACAACTCTTCCCACATCTCCTTAAACCAGCTTTGTGAGGGAGAGCAATCCAGTT
GCCACCAGTGCCTTGTTTCTCTATGTAATCTTTAAGCTTTGCATCTTCTTCCGGAGACCATGGACCTCTCTTCACATTTGCTTTGTCACAACAT
GGAGCCCTCCCCATCTCTCTACGATCTCTCTCGGTCCTTATAGCTACTCTGTGTGTTCTGTTTGAGGAATCTTGGTTTCGTTTTTGAAGA

Primers for UN11213 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 ACCAAACTGTCCATGGCTTC 59.973 20 CCTCCACCACCTCATCAACT 59.962 20 215 253 467
2 GGCTGTCTTCTTGATGGCTC 59.957 20 CCTCCACCACCTCATCAACT 59.962 20 265 203 467
3 CCAAACTGTCCATGGCTTCT 60.111 20 CCTCCACCACCTCATCAACT 59.962 20 214 254 467