 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN11609
GACGCCGTGCTTGGTGCTGGTTTTGCTGGAATCTCTGTTGCGTGGCACCTTCTCAAGGACTGTCCAAAGGAGGTGAGTTTAAGTGTTGATGTAT
ATGATGAAGTTGGCATAGGAGGTGGTGCTTCTGGAGTTTCTGGAGGCCTACTCCACCCTTATTCTCCTAAAGGCAAGCTTCTTTGGCATGGTGC
TGAGTGTTGGAGAGAGTGTTTAGAGCTCTTAAGTGTTGCCGAGACAGCAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTCTGATGCTGTGGAGAAGGGAGACTGT
AACCAGAGTTTTGGAAACTTTATGGTTCGAAGAAGGGGAATCTTGAGACCAGCAACTAATGCCAAGACTTTGGGTTTAATGACTGATAATGCTC
GAAACTGCCTTGCCGGTTGTGTAGTAGAGACTATTGACAAGGATGTTACCCAAAACCTTGTCCCCAATCTAGGCTTGCCTTTGAACTGCGCCTT
CTATCTCCCAGGAGCTATGAATGTTAATCCGCAGCGCTATCTCCAGGCACTCTTTCAAGCATGCCAAAACTCAGCAAATCACTTGGAAGTACAA
ACATAACTTTGGTGAAGAGATCTATAGATGATGTGCTTGAACTTGAAGGAGAATATGATGCTGTTGTAATATGTCTTGGATCCAAGCTAAACTT
TCTTCCTGGGCTCACTGGAAAGCTCCCCTTAAGGACATGCCGTGGTGTCATTACTCATCTGCAGTTACTCGAGAGTGTCAAGGGAAGTTACCCT
GAAGGTGGACCTTCGATATTGTCAGATGCATGGCTCGCGGTTCAGGGACCACGTGACATACACATGGGATCCACATGGGAATGGCAGTCAAGAA
ACTATTCACCTGATGTCTCAGATGATGAAGCTTCAAAAGCTCTGGCCGAGCTTCTTCCAAAGGCGAGTGCAGTTTATCCAGACATAGACAAGTG
GGAGTTTGCAGGAGCAAGGGCGGGTTTGCGAGCAATGCCACCTGTTACAAGCCATGGTTCACTACCGCTCTTGGGATGTATAGACCAGCTCATA
GGTGCGGCCGAAGGTGGACCTTGCAAGTTTTGGGTGTTTGGAGGGCTTGGATCAAGAGGACTGCTCTATCATGGTTGGCTTGGGAAACTTATTG
CTAAAGCTGTTTTATGTTGTAATGAAGAATTAATCCCTTCTGAACTCACTTCTTGGAAGATGAATAATAGAGTGAAAAGTTGAAACAAGTTCC |
Primers for UN11609 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
AGTTGGCATAGGAGGTGGTG |
59.989 |
20 |
AGTCTCCCTTCTCCACAGCA |
59.986 |
20 |
179 |
102 |
280 |
| 2 |
AGTTGGCATAGGAGGTGGTG |
59.989 |
20 |
CAGTCTCCCTTCTCCACAGC |
59.986 |
20 |
180 |
102 |
281 |
| 3 |
TGGTGCTGAGTGTTGGAGAG |
60.022 |
20 |
CAAGCCTAGATTGGGGACAA |
60.066 |
20 |
271 |
183 |
453 |
|
|
