Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN12072
GGAAATTAAATAGACACAAGTGCGTGCGTGAACTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTAAGCAGTAGAGATAAACAAACATCAATGGCG
ATTCCAATGCCAACTCGACAGCTATTCATCGACGGCGAGTGGAGAGAGCCAATCTTGAAGAATCGCATCCCCATCGTCAATCCAGCTACCCAAG
ATGTCATTGGTGATATCCCGGGGGCAACAAAGGAGGATGTGGAAGTAGCAGTCAACGCTGCTCGAAGAGCTTTCTCAAGGAACAAAGGTAAAGA
CTGGTCCAAAGCATCAGGAGCTCTTCGCGCCAAGTATCTACGCGCTATTGCTGCTAAGGTGACTGAAAGGAAGTCGCATCTGGCAACGCTTGAG
TCGCTTGACTCTGGTAAACCTTTGGATGAAACTCTTTGGGATATGGAGGATGTTGCTGGATGTTTTGAGTTTTATGCTGACCTTGCTGAAGGAT
TAGATGCTAAGCAGAAAGCTCCTGTTTCTCTTTCCATGGAGAGTTTTAAGAGTTATGTTCTCAAGCAACCTCTTGGAGTTGTGGGACTCATCAC
ACCTTGGAATTACCCTCTTCTGATGGCTGTTTGGAAGGTGGCTCCTTCGCTTGCTGCTGGATGTACTGCCGTTCTCAAGCCATCAGAGCTCGCT
TCTGTCACTTGTTTGGAGCTTGCTGATATTTGTCGTGAGGTTGGTCTTCCTCCTGGTGTTCTTAACGTTCTTACTGGATATGGTTCGGAAGCTG
GTGCTCCTTTGGCTTCACATCCCAATGTCGACAGATTGCTTTTACCGGAAGTTTGCCACGGGAAGCAAGTCATGACATCTGCTGCTCAG

Primers for UN12072 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 AATAGACACAAGTGCGTGCG 59.935 20 TAGCTGTCGAGTTGGCATTG 60.011 20 110 9 118
2 AATAGACACAAGTGCGTGCG 59.935 20 AGATTGGCTCTCTCCACTCG 59.555 20 141 9 149
3 AATAGACACAAGTGCGTGCG 59.935 20 GTCGAGTTGGCATTGGAATC 60.47 20 105 9 113