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Simple sequence repeat (SSR)
>UN12087
GGTTCAGAAATGGTTTGACCAGGTCGAAAGTGGTCAGTTAATAATTTACTTTACTTTTTATTTGTAACTTTAAAACCAAAAAAAATGATTTTTA
AATTTATGGTAAGCTCATGAACTCGAATGTCCCCGCCGCCCTTTCACCTTTTGTGTTTAGAAAGTTTTAATTGTGAAATAACGGAGCAAATCAA
TTCAGAGAGGGTATAGTTTATGGTTATAGTTTGTAAGTACAAATTAAGTTGAAACACTTGCTATACTAACCAATCACCCCATATGTTTGAATTT
TTGTTTTTGTTTTGATGTAGTGAAAAGTAATGTCAAAATGTAAGAATGGGTGAGGGTTGTTATGATATACTCCCTCCGTTTCGTAATACTTGAT
GTTTTACCATAGTGCACAAAAATTAAGAAAATTGTATTTTTAACTAAAAAATATTTTAAAGATATAATTTTAAAATCAATTAACCAATAATAAA
AAAGACTGTAAAATCTAATTGGTTGAACAGTTTCCAATAAAACTAAAGTAACCTTAAAATCTCAAAACTTCATCTAATTTGAAACAAAATTATC
CTTCCAAAACATCAACTATTATGAAACGGAGGAAGTATTATTATCACTTTACCCAAAATTGATTTGAATCCGGAGTACAAAAGAACCAACTCCT
GTACACTACCACTAGGCTACCAACACGATGAATACTAACCATGTGTGGTAATGTAATTGTGGTGAACTATATTTTATTTAGATAAGTATATCTT
CAAATTTCTCTACTCTTAATCCATTTTTAGTAGATGTAAACACAAAAAACTCTCCCCAATTCAAGTAAGACGAGTCATTAACATAGAAGAAAAA
TTCAACTAGAACAAGTCACTAAGTTTGTGGTTGTGTGTGTGTGAGAGGGAGTGAGAGAGACAACATTCATGTTATTGTATCACATACTGTCAGA
AATCCTAATA |
Primers for UN12087 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CCACTAGGCTACCAACACGA |
58.799 |
20 |
CATGAATGTTGTCTCTCTCACTCC |
60.175 |
24 |
251 |
667 |
917 |
| 2 |
ACCACTAGGCTACCAACACGA |
59.671 |
21 |
CATGAATGTTGTCTCTCTCACTCC |
60.175 |
24 |
252 |
666 |
917 |
| 3 |
TCCCCAATTCAAGTAAGACGA |
59.555 |
21 |
CATGAATGTTGTCTCTCTCACTCC |
60.175 |
24 |
113 |
805 |
917 |
|
|
