 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN12129
GATATTCCTGTTGTTGATCTCTCTAAACTGTCTAAACCTCACACTCATGATGATTTTCTCTTTGAGATTCTTAAGCTGTCACAAGCTTGTGAAG
ACTGGGGATTTTTCCAGGTTATAAATCATGGGATTGAAGGGGGTGTGGTGGAAGGTATAGAGAAGGTGGCCAAGGAGTTCTTCGAGATGCCACT
GGTGGAGAAGAAGAAGTATCCAATGGAGCCAGGGACCGTACAAGGTTACGGTCAAGCTTTCATCTTCTCTGAAGATCAGAAGCTTGATTGGTGC
AACATGTTTGCTCTTGGTGTTCATCCTCCTTCTATTCGCAACCCCAAACTATGGCCTTCTAAACCGGCCCGGTTCAGTGAAAATCTTGAAGGTT
ACTCAAAAGAGATAAGGAAATTATGCAAGAGGTTGTTGAAGTACATAGCAATAAGCTTGGATCTAAAGGAAGAGAAATTTGAAGAAATGTTTGG
GGAAGCAGTGCAAGCCGTAAGGATGAACTATTACCCACCATGTTCACGTCCTGATCTTGTCTTGGGACTCAGCCCACATTCTGATGGTAGTGCT
CTCACTGTTCTTCAACAGAGTAAGAACAGCTGTGTTGGGCTTCAGATCCTCAAGGACAACACTTGGGTCCCTGTACTACCTCTTCCCAATGCCC
TTGTCATCAACATTGGTGATACAATTGAGGTGTTAACTAATGGGAAGTACAAGAGTGTAGAGCATAGAGCAGTGACAAACAGAGAAAGGGAGAG
GCTTACCATAGTGACATTCTATGCACCAAACTACGAGGTTAAAATAGAGCCAATGGGTGAGTTGGTTGATGATGAAACCAACCCATGCAAGTAT
AGAAGCTACAATCATGGTGACTATAGTTATCACTATGTCTCCAACAAGCTCCAAGGCAAGAAGTCACTTGATTTTGCCAAGATTCTCAATTAAC
TATATTATTTTCACACCCCTTTCCCCTTCCATTAACTAGTTACCACTTAATTTGTTTTAATTTTAAGAATTTAGTTGTGGGACTCTTGTGAGTA
TAATGTACAGGAATGTTTCCCACTTAGGGGGTTTAGTGTCATGATTAAATCCCCCAATGTAACTACAACTTGTAATATATTATGTGTGTGTGTG
TATGGTGGAGTTGGGTGTGTTTATGTGTTCATATGTATGCCGAGAAGGAACATAAAGAATAAGAAAGAACAAGATCAGATCCATGTTTATGTCG
|
Primers for UN12129 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
| 1 |
CCCTTTCCCCTTCCATTAAC |
59.639 |
20 |
TCTTTATGTTCCTTCTCGGCA |
59.831 |
21 |
230 |
957 |
1186 |
| 2 |
TGTTTCCCACTTAGGGGGTT |
60.581 |
20 |
TCTTTATGTTCCTTCTCGGCA |
59.831 |
21 |
139 |
1048 |
1186 |
| 3 |
GTTTCCCACTTAGGGGGTTT |
59.191 |
20 |
TCTTTATGTTCCTTCTCGGCA |
59.831 |
21 |
138 |
1049 |
1186 |
|
|