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Simple sequence repeat (SSR)
>UN12258
GCTGTAATATTTGTCCTTTTGTTGTTATTTAGCTCCATTAGTTTCAAAAAAGGATTTAGCTCCACTGGTTCATATCATATATATATTCCTTTAC
TTAAGCTAGCCTGGATATAACTGATTCTAGTATGCGATTTTGACTAAAATAACTGAAATTAATAATATGATTTAAATCCAGAGTCAAACATATA
CAATCGAATCTTGGTCTTAGTACTTTATGTTATGTTGTGGGCTTCCGTCCAATATATTAGAAGAAGGTATACTGGATTAGAGATTGATGATAGG
CTGATAGCTAAGGAACACAAACGTGTTTAAAAACACAACAAAATAGCACTGAACTCTCTCGTCGGTCTATAATGATATTAACATATATATATAT
ATATATCCCCTAGTCTATATTTGAGAAGTGATTTTGGCACATGTCATCTTTACGATCAGTCTCACAAAAGAAAATATGACATGGCTACTACAAT
TGATGACATGGCTTCCGAAAAATATGACATGGATTATTTCATTTAATGTTGATTTATATTTTTGGTAAACTTTTTAAAATAAGGTAATAACTCA
TACCCTACATTTAATATTGAAATTTATTTTTGGTAAACTTCTTTAAATATGGTAATATCGCATACATCATCTCTAAAATAAATATATTCATATA
TAACATTAAAATTTCGAAATTATATTTTGTTTTATTTTCTATAATTATACAATTTGTATTGCCACATGTCCTTTTTACAATCAGCTTCACAAAA
ATATATGACATGGCTACTAAAATGATGACATGGCTCCG |
Primers for UN12258 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CACTGAACTCTCTCGTCGGTC |
60.041 |
21 |
ATTTTTCGGAAGCCATGTCA |
60.448 |
20 |
165 |
329 |
493 |
| 2 |
GTTATGTTGTGGGCTTCCGT |
59.859 |
20 |
CGTAAAGATGACATGTGCCAA |
59.6 |
21 |
214 |
217 |
430 |
| 3 |
GCACTGAACTCTCTCGTCGG |
61.155 |
20 |
ATTTTTCGGAAGCCATGTCA |
60.448 |
20 |
166 |
328 |
493 |
|
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