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Simple sequence repeat (SSR)
>UN12865
GCAGGTGTATTGGTGGCGACGGAGCTCTCTCTCTCTCGGTGGCGGCTCCGGTTCGTCGAAGCAGTGGTCCGGGACTGTCCTATGATGATATGGA
GGAGAGGTTGGCGGGTGTTCCCGTTGCTTCGACAAACACGTTTACTCAACCAGATGAAGATGCGGAGGCGTTGTTCAACAAGATGAAGATTATG
GAAGTCTCTGGGTTATGTTGTTCTGTAAGGAGGAAGATGCGGAGGCGTTGCTCAACCAGATGAAGATTATAGACCCTCGGATTAAGAAAGAAGG
TTCCAAAGTTGTTGCTCTTGCTCTTTAGTAAGGTGTTCCAGTTAAAAGTTAATGGTGTGGCGTTTAGGTTGATTCTTGAGTCTACTCAAGTTAA
AAATGCTCTCAAGGTATGTTGATTTTGGTGTTAATAATATTGTTACAGATAATGTGTCAAGAGATTATGCATTATGTATTTGGCCTTAGATATT
GTGCTGAGGTTTCTGGTAAAACAAGCATTTTTTTTTCTTTAATCATCTCATCTATAGTTTGTTTTCTTCAAAACTGCGCTACTAGCATTCAGTT
TTGGTACATTTTTACACATTGGTCTTATGGATATGAACTTCTTTGTAGTAGTTGCGCGTAGTTTCTAAATGTATATCTCTTTGTAAACAAGCAT
TTTTTTTCTTTAATTATCTCATCTATAGTTTGTGTAATCATCAGTTTTGATCCAAAAACCTTTAATATATTGAGTGTTTTTATTTGAAAATATA
TTAAGTGTAAAGCTTCTGTTTTTATTTGTTTGTTTGAAACATTAACTAGTTTCTGTGTGTTTGTGTGACTGTGTCTTAACATACGAGGATGGAG
GGTAGAAGCCGAAGGAAGCTCATTCAAAGCAGAGGAGTACATTTGGTCTTCGCGAGACAGAAATGGATAAACGAACGAGGTGGATACATTCGGT
ATGAGGTGGTGTGGATACATTCGGTATGATATTTCAGGGTTCCAAGATGGAGAAGGTTCACATGTCGATCTCAACTTTTCTACAAATACAGATT
CAATGATCCCCGATATGATTCCTACTGAAACTACAATTCGTGATATACAAATGCATCAACAACTGAAAGATGATTTGGTTCAACATATATGGCA
TAAATTTGGACATGAAGGAGACAACAACTGATCTCGGGACCAGATTTCAAATTATTCTCTTTTATTTACTAATGTATTTTTTATGTTTTTATTT
CAATCTATGTTTTAATTGTTATCTTTTAATATGTTTCATA |
Primers for UN12865 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
AGGTGTATTGGTGGCGACG |
61.934 |
19 |
CCGCATCTTCCTCCTTACAG |
59.83 |
20 |
228 |
3 |
230 |
| 2 |
GTGTATTGGTGGCGACGG |
60.969 |
18 |
CCGCATCTTCCTCCTTACAG |
59.83 |
20 |
226 |
5 |
230 |
| 3 |
GGTGTATTGGTGGCGACG |
60.969 |
18 |
CCGCATCTTCCTCCTTACAG |
59.83 |
20 |
227 |
4 |
230 |
|
|
