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Simple sequence repeat (SSR)
>UN13432
GTAATCTAACCAAGAGGAAGAAGGAGTCGACTGTTGGTGGATAAGGTGACTATTAACCAGTCCAAGACAGGCTGTAAAGTAAGCTAGGCGTGTG
AACAATCTCAGCCAAGTGTGGAGCTTCTTCCCATTGACCTCACATGTGTGTAATAGTCTCTAGTCTTGCGCAAACCTTACTCTCCCTCTTGTAT
ATATTTGTAACTCCTCTCATTAATCAAATCATACACTTGGAGTCTCTTTCTCTCTTTGCAATGTTACTATTACATCTCTCTCTCTCGGGTTACT
ATTGAATCTGCGAATACAAACTCTCTCAAATCTCTTCTTTTCTCTTCTAATCTTACACTAATCTCTCAATACACTTTATATTCTCTAAAATCTC
ATAAGTGACCAGTTGTCTTATGTCTCTATAAGGTCTGTTTGTTTAGTCTCTAGGGAATGATAGTTCATAACATTCAGTACATGTCGGTTTATCC
CCTCTCACAACAAGAACTATAATTAAATTATTACAATTTCAAGTCACAGACCTTTGTGATCTTAACTCTGTTGCTTGAAGTAATACGTAAGTTC
ATAATCAAAGAAAAAGCTTTATGCCAGAGATAACGGACCTTTATTTTCTTAAATAAAACATCACAACATTCAATACATTGTCGGTTTATCCCCT
CTCACAGAGAAACAAGAACTATAATTAAATTGAAGTTTTCACAGACAAACAAGAACTATAATTAAATTGAACTTTTCAACTTATACTCTTCTAA
TCATGATGACTCGAAAAGCAAGAGAATAACTTATTGAAAAAAGACCTTTGAGTCCTCGGCTTAGGAGCAGCATGTGGTGCTTCTGATTGTGATG
ATGATGATGGCATTTCAACTTGATCATCATCATCATCCACGCAGTAAACAATCTCGTTTTCATCACATCCTCTTTCTCTTGCCTTTCTAGCCTC
TTCTATAAACTTATCAAACGCGTTTGTAACGTATTTGGAAGCTTCTGCAACGCAAGTTTCTTTGCAAAGCTTGTGTATCAATTCTTCGTTTTTG
TAGTCTCCTTTTAATCCCGCAGCCATTATCACGAGCTCTTGTTGGAACTCGCTTAATTGTGCACTTTCTTCTGCTACCGTTGCTCTCAGTTTAA
CCGGAATTGGTAATGTTTCAGGGCAGTCTTGTCTTGGTGAATCTCTTGTAATAACAGATTCAAAAGTGCCAGCCCATGAATCTCTCTTTGTCAA
GAAATCTTTGAGGTTGAAAATTTTCTTGACCGTTGCAGGAATTGATGAGTGCTCATATTGTGACCTAGGGTACGGTCCATTCGGCCCATGAAGA
ACTGTGCCAGGCTCAATC |
Primers for UN13432 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTGGAGTCTCTTTCTCTCTTTGC |
59.291 |
23 |
TTGTGAGAGGGGATAAACCG |
59.926 |
20 |
256 |
225 |
480 |
| 2 |
GCCAAGTGTGGAGCTTCTTC |
59.997 |
20 |
TTGAGAGAGTTTGTATTCGCAGA |
59.167 |
23 |
207 |
105 |
311 |
| 3 |
CAAGTGTGGAGCTTCTTCCC |
59.844 |
20 |
TTGAGAGAGTTTGTATTCGCAGA |
59.167 |
23 |
205 |
107 |
311 |
|
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