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Simple sequence repeat (SSR)
>UN13432
GTAATCTAACCAAGAGGAAGAAGGAGTCGACTGTTGGTGGATAAGGTGACTATTAACCAGTCCAAGACAGGCTGTAAAGTAAGCTAGGCGTGTG
AACAATCTCAGCCAAGTGTGGAGCTTCTTCCCATTGACCTCACATGTGTGTAATAGTCTCTAGTCTTGCGCAAACCTTACTCTCCCTCTTGTAT
ATATTTGTAACTCCTCTCATTAATCAAATCATACACTTGGAGTCTCTTTCTCTCTTTGCAATGTTACTATTACATCTCTCTCTCTCGGGTTACT
ATTGAATCTGCGAATACAAACTCTCTCAAATCTCTTCTTTTCTCTTCTAATCTTACACTAATCTCTCAATACACTTTATATTCTCTAAAATCTC
ATAAGTGACCAGTTGTCTTATGTCTCTATAAGGTCTGTTTGTTTAGTCTCTAGGGAATGATAGTTCATAACATTCAGTACATGTCGGTTTATCC
CCTCTCACAACAAGAACTATAATTAAATTATTACAATTTCAAGTCACAGACCTTTGTGATCTTAACTCTGTTGCTTGAAGTAATACGTAAGTTC
ATAATCAAAGAAAAAGCTTTATGCCAGAGATAACGGACCTTTATTTTCTTAAATAAAACATCACAACATTCAATACATTGTCGGTTTATCCCCT
CTCACAGAGAAACAAGAACTATAATTAAATTGAAGTTTTCACAGACAAACAAGAACTATAATTAAATTGAACTTTTCAACTTATACTCTTCTAA
TCATGATGACTCGAAAAGCAAGAGAATAACTTATTGAAAAAAGACCTTTGAGTCCTCGGCTTAGGAGCAGCATGTGGTGCTTCTGATTGTGATG
ATGATGATGGCATTTCAACTTGATCATCATCATCATCCACGCAGTAAACAATCTCGTTTTCATCACATCCTCTTTCTCTTGCCTTTCTAGCCTC
TTCTATAAACTTATCAAACGCGTTTGTAACGTATTTGGAAGCTTCTGCAACGCAAGTTTCTTTGCAAAGCTTGTGTATCAATTCTTCGTTTTTG
TAGTCTCCTTTTAATCCCGCAGCCATTATCACGAGCTCTTGTTGGAACTCGCTTAATTGTGCACTTTCTTCTGCTACCGTTGCTCTCAGTTTAA
CCGGAATTGGTAATGTTTCAGGGCAGTCTTGTCTTGGTGAATCTCTTGTAATAACAGATTCAAAAGTGCCAGCCCATGAATCTCTCTTTGTCAA
GAAATCTTTGAGGTTGAAAATTTTCTTGACCGTTGCAGGAATTGATGAGTGCTCATATTGTGACCTAGGGTACGGTCCATTCGGCCCATGAAGA
ACTGTGCCAGGCTCAATC |
Primers for UN13432 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CAGCATGTGGTGCTTCTGAT |
59.862 |
20 |
CAAAGAAACTTGCGTTGCAG |
59.65 |
20 |
185 |
820 |
1004 |
| 2 |
CAGCATGTGGTGCTTCTGAT |
59.862 |
20 |
AAGCGAGTTCCAACAAGAGC |
59.621 |
20 |
269 |
820 |
1088 |
| 3 |
CAGCATGTGGTGCTTCTGAT |
59.862 |
20 |
TAATGGCTGCGGGATTAAAA |
60.405 |
20 |
243 |
820 |
1062 |
|
|
