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Simple sequence repeat (SSR)
>UN13706
GGACTGAAAACGGCGTCGTTGAGCTTGGTTCGTTGGAGGTTATACATCAAAGCTCGGATCTTGTTGATAAAGTCAACGGCTTTTTCAGTTTCAA
CGGTGGAGGTGGAGGCGAGTCGGGTTCTTGGGCAGCGTTTAATTTGAACCCGGATCAAGGAGAGAATGATCCCGCTACTACGTGGATTAACGAA
CCGGATGTAACCGGAATCGAACCGGTTCTTGGGGTGAACACCGGTAATAATAATAACTCGACTTCTTCTAACTCTGATTCTCAGACAGCTTCCA
AGCTTTGTAATGGAAGCTCGGTGGAACACCCTAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAACCCACAGATCTCTAGTTCTGGGTTTGTGGAGGGAGGAGA
CAGCAAGAAGAGGAAGAGATGTTTGGTTTCAGACAAGGAAGAGGAGATGCTGTCTTTCACTTCTGTTCTTCCACTTGCTACTAAAACAAACGAT
TCGGATCACTCTGATCTCGAAGCTTCGGTTGCTAAAGGACCAGAGAGTGGTGGTAGAACCGTGGTTGAACCGGAGAAGAAACCGAGAAAACGAG
GGAGAAAACCGGCGAACGGAAGAGAGGAGCCGTTGAATCATGTGGAGGCAGAGAGGCAGAGAAGGGAGAAGCTGAACCAGAGATTCTACTCTCT
GAGAGCTGTGGTTCCTAATGTCTCTAAGATGGATAAGGCTTCGCTTCTAGGGGACGCGATTTCGTATATCAATGAGCTTAAAGCTAAGCTGGAG
AAGGCTGAGTCTGATAAAGAAGAGTTGCAGAAGAAGATCGATGGGATGAGCCAAGAGGTGGCGAGTGGGAATGTGAAAAGTTCGGTTAAAGATC
AGAAGTGTGTGGATCAAGATTCAGGTGTGTCGGTGGAGGTGGAGATCGATGTGAAGATCATTGGTTGGGATGCGATGATTAGGATCCGATGCGG
TAAGAAGAATCATCCTGGTGCTAAGTTCATGGAAGCACTCAGGGAATTGGAATTGGAAGTGAGTCATGCGAGTTTATCGGTAGTTAATGAGTTC
ATGATCCAGCAAGCGACTGTGAAGATGGGGAATCAGTTTTTCACGCAGGATAAGCTCAAGGCTGCTCTAATGGAGAGAGTATGAGAAGGCACAT
GTAAGATAAGTTAGCATCTCTAGAGGGTAATAAACCGAAGAAACAATGCTAAAACAAGGGTCACAGTATGAACCAGTAAAAATCTCATGTGATT
GTAGTGTAAAATGTATTGTGCAAAGGGTAATTTTGCAGCAGAGCACCCAAGTTGTTATTTGATGCTTTGTTAGAGAAGTTTTAGTTTGATGGTA
AGTAGTTTGGGCTGTAAGCTTTTCATGAGATTAAGTGTCTTCGGTTTGTTTGGTGCATTGAGTGGGTATGTACATATTATATTATTATGTAATG
AAATAAGGTTTTTATTTGTAATGAATAAAATCAAAATGGGATTTG |
Primers for UN13706 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GTAATGGAAGCTCGGTGGAA |
60.074 |
20 |
TTCTTCTCCGGTTCAACCAC |
60.088 |
20 |
262 |
289 |
550 |
| 2 |
ACCCGGATCAAGGAGAGAAT |
59.896 |
20 |
TGTCTCCTCCCTCCACAAAC |
60.088 |
20 |
237 |
142 |
378 |
| 3 |
TAATGGAAGCTCGGTGGAAC |
60.074 |
20 |
CTCTGGTCCTTTAGCAACCG |
59.869 |
20 |
226 |
290 |
515 |
|
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