|
Simple sequence repeat (SSR)
>UN16235
GAGAGAGAGAGAGAGGAAGCAGAAGAAGATAGATAGATTCGATTCAGACCAGAGAATCGTAGATTGATCGAAGAAGATGAACACTGACATCACT
GCCTTGGAGAAGCCCCAATACCCCGTCGTCGATCGGATCCACCATTCACAAAAGTCGTCTTCAAGCTGTGGATGGAGTGGAGGATAGCGAGTCC
GAGTCCGGGGAGGAGATTGATGAGGAGGAAGTTGGGGATGATGATGTGGTTGAGGTTCATGAGATTGAGGATAGTGATAATGAGGAAGATGGGG
TTGATGATGAGGAGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGAAGTGGATAATGTCGATCGTGGTCTTGGTGGGTCAGGGAGTAGTACTGGACGGTT
GATGAATGCGGTGGAGATTGATGGGCATGAGCAAGGGGATGATGATGAGGATAATGATGGTGAGACTGGTGAAGACGACCAAGGGGTTGAGGAT
GATGGTGAGTTTGGTGATGATGATGATGATGATGATGGTGATGAGGAGGATGAAGAATCTGGTGAAGGGTATCTTGTTCAGCCAGTCTCTCAAG
TGGAAGATCATGATGCTGTGGGTAGTGACATCGAACCCATTAACGAGGACAACGATCCAGATGAAGAAGAAGAAGTGGAAGATGATCTCCCAAT
GCCTGACCAGTCCTTGCCATCATCATTTCGTCCAAAGAGAAAACGTGATGGTGATGAAGATGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGAT
GATGACGATGATGGGGTTGATGATGAGGAAGATTAGTTGTGTACACACAAACCGTTGCTACTTGTGGAATAGGGCGGCAATGTTCAAAATAGTC
AGTTATGGTGAGGCTGGTGGATTTTCAAATGACGGTTACTCAAGTTGGATTTACCGCCCTTTTAGAAACCCCCAACGTTATGGAGGGAAAGAAC
CAAAAAAACAAAACAAAGACAGGATATGATAGTGTTCTCGAGACCTTGTTTCTCTGTTAGAGGGTCTTGTAACATGCCTTTATGTAATAAATTT
TTTGAAGTTATATCTCATCAGTCTTCTGTTTCACTACACTTACACATGTCGTATCGTTATTGGCCAGGATGC |
Primers for UN16235 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
TGGATGGAGTGGAGGATAGC |
60.034 |
20 |
CTCATCATCATCCCCTTGCT |
60.034 |
20 |
263 |
163 |
425 |
2 |
TTGATGAGGAGGAAGTTGGG |
60.042 |
20 |
CTCATCATCATCCCCTTGCT |
60.034 |
20 |
221 |
205 |
425 |
3 |
TTGATGAGGAGGAAGTTGGG |
60.042 |
20 |
CGTCTTCACCAGTCTCACCA |
59.864 |
20 |
249 |
205 |
453 |
|
|