Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN16235
GAGAGAGAGAGAGAGGAAGCAGAAGAAGATAGATAGATTCGATTCAGACCAGAGAATCGTAGATTGATCGAAGAAGATGAACACTGACATCACT
GCCTTGGAGAAGCCCCAATACCCCGTCGTCGATCGGATCCACCATTCACAAAAGTCGTCTTCAAGCTGTGGATGGAGTGGAGGATAGCGAGTCC
GAGTCCGGGGAGGAGATTGATGAGGAGGAAGTTGGGGATGATGATGTGGTTGAGGTTCATGAGATTGAGGATAGTGATAATGAGGAAGATGGGG
TTGATGATGAGGAGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGAAGTGGATAATGTCGATCGTGGTCTTGGTGGGTCAGGGAGTAGTACTGGACGGTT
GATGAATGCGGTGGAGATTGATGGGCATGAGCAAGGGGATGATGATGAGGATAATGATGGTGAGACTGGTGAAGACGACCAAGGGGTTGAGGAT
GATGGTGAGTTTGGTGATGATGATGATGATGATGATGGTGATGAGGAGGATGAAGAATCTGGTGAAGGGTATCTTGTTCAGCCAGTCTCTCAAG
TGGAAGATCATGATGCTGTGGGTAGTGACATCGAACCCATTAACGAGGACAACGATCCAGATGAAGAAGAAGAAGTGGAAGATGATCTCCCAAT
GCCTGACCAGTCCTTGCCATCATCATTTCGTCCAAAGAGAAAACGTGATGGTGATGAAGATGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGAT
GATGACGATGATGGGGTTGATGATGAGGAAGATTAGTTGTGTACACACAAACCGTTGCTACTTGTGGAATAGGGCGGCAATGTTCAAAATAGTC
AGTTATGGTGAGGCTGGTGGATTTTCAAATGACGGTTACTCAAGTTGGATTTACCGCCCTTTTAGAAACCCCCAACGTTATGGAGGGAAAGAAC
CAAAAAAACAAAACAAAGACAGGATATGATAGTGTTCTCGAGACCTTGTTTCTCTGTTAGAGGGTCTTGTAACATGCCTTTATGTAATAAATTT
TTTGAAGTTATATCTCATCAGTCTTCTGTTTCACTACACTTACACATGTCGTATCGTTATTGGCCAGGATGC

Primers for UN16235 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 TGGATGGAGTGGAGGATAGC 60.034 20 CTCATCATCATCCCCTTGCT 60.034 20 263 163 425
2 TTGATGAGGAGGAAGTTGGG 60.042 20 CTCATCATCATCCCCTTGCT 60.034 20 221 205 425
3 TTGATGAGGAGGAAGTTGGG 60.042 20 CGTCTTCACCAGTCTCACCA 59.864 20 249 205 453