 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN16629
AGGGGAAGTCCACCGCCTGCTACTCGGAGCTCCCCAGCTCACCAGTCTTGGCACTGGCTCCTTTAAACATGATAATCAGTCCGAGCGAGAGCAA
GAGCAAGAACCCGATTACGCCTCTGCTTTCCGTGCTTGTAAATCTGTAGTTTGCCTTTCGGGTTTCAGGGAGTTAATGCCTGAGTACCTTCCTG
CTATCTTACCCGTCTGCGCAAATCTTACCTCTCTCAATTTCAGTTATGCTAACATTTCTCCTGACATGTTTAAGCCCATCATCCACACTTGCCA
CAAACTCCAGGTTTTCTGGGCTCTGGATTCGATATGTGATGAAGGACTGCAGGCAGTTGCTGCGACTTGCAAGGAACTCCGTGAGCTCCGGATC
TTCCCTTTTGATCCCCGAGAAGACAGTGAAGGTCCTGTCTCTGAATTAGGCCTACAAGCAGTCTCCGAGGGTTGTAGAAAACTTGAATCTGTTC
TCTACTTTTGCCAGCGCATGACTAATGCCGCCCTGATAGCCATGTCACATAACTGTCCTGAGCTTACTGTGTTCAGGCTCTGCATAATGGGTCG
ACATAGGCCTGACCATGTGACAGGAAAGGCTATGGACGAGGGTTTTGGTGCCATTGTTAAAAACTGCAAGAAACTAACTCGGCTCGCCGTCTCC
GGGTTGCTTACGGATCAAGCTTTTAGGTATATGGGTGAGTATGGGAAACTGATCCGTACTCTGTCAGTAGCTTTTGCAGGGGACAGTGACATGG
CTCTGAGACATGTCCTCGAAGGTTGCCCTAGACTACAGAAACTCGAGATAAGAGACAGTCCGTTTGGGGATGTTGCGTTACGCTCTGGTATGCA
TCGGTATTACAACATGAGGTTTGTTTGGATGTCGGCGTGCAAGCTGTCTATGGGATGTTGCAAGGATGTTGCACGTGCAATGCCAAATCTTGTT
GTGGAAGTAATTGGTTCGGATGATGATGATGAGAATAGGGAGTTTGTTGAGACTTTATACATGTATCGGTCTCTTGATGGTCCAAGGAAAGATG
CACCACAGTTTGTCACAATTTTATAGGAAAGAGGAGCCTTTTCGTGTGTTGCTGAGAGAGCTTAAAGAGGGGAGAATGAGAATGGGTTGGGGTA
GGAATGCTGAAGATGATGATGGTGGTGGCGTCAGAGACAAAATGCATGATGGTTGATGATGATGATGATAGTTGCGAAGGGCATAATGCATGAT
TGTTGTACCATTATTTATTTTCATTTCTTTTTTTTTTCTTCTTTAAAGTTCTTGGTTGGTTAGGTGGAACAATGGATGTATGTTTTGGGGGAGT
ATCGTTGTTAGTTAGACAGATGAGTTGGTTCTTATGTTTCTAATAAGCTGCACTTTTGGATCGATCTTTCTAGTTGTTGTTTAGAACTAATGAG
ACGTCTTTCCATTTTCAATTAATTTGAGATATTTCATCTGAATCCGTT |
Primers for UN16629 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTGGGGTAGGAATGCTGAAG |
60.066 |
20 |
CCCCCAAAACATACATCCAT |
59.363 |
20 |
193 |
1121 |
1313 |
| 2 |
GTTGGGGTAGGAATGCTGAA |
59.933 |
20 |
CCCCCAAAACATACATCCAT |
59.363 |
20 |
194 |
1120 |
1313 |
| 3 |
GAATGGGTTGGGGTAGGAAT |
59.881 |
20 |
CCCCCAAAACATACATCCAT |
59.363 |
20 |
200 |
1114 |
1313 |
|
|
