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Simple sequence repeat (SSR)
>UN18278
GGCTGATAAAGCTCTCTCTCAGTGTCCTCTCTAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCCGCGGAGTCACCGAAGTTTCTCTGATAGACGGC
TATAAAACAAAAGGATAAATAATGCAGTCGTCAACGTATGCAGCAGCAGTTAAAGGAAACGCCGCGTTTGCGTTTCAGAGACGTAGTAGCTTCT
CTAACCTCGTCGTCAGCAGATCGGTGGCTGCTACCGGAATTCGATTCTCCACCGGCTCTTCTACCTCGAAAGCCATCATGGGAGCTAAACTTGT
TCGCGCTGAAATCGGGATCCACAGTCTCTCCTCCTCGGTCAAAGCTCGATCGGTCAGAGCTCAAGCCTCCTCTGGTGGTGGTGATGAGGAAGAA
GCTATACCTTTGAGATCTCAACAAGGGAATAGCTCCGGGACTGTTTTACCCTTTGTTGGTGTTGCTTGTCTTGGTGCTATCTTGTTTGGTTATC
ATCTCGGGGTTGTTAACGGTGCTCTTGAGTACCTTGCTAAGGATCTTGGTATCGCTGATAATGCTGTTTTGCAAGGGTGGATTGTTGGCGCGTT
GCTTGCTGGTGCAACGGTCGGTTCTTTCACCGGTGGTGCATTAGCTGACAAATTCGGACGAACTAGAACGTTTCAATTGGATGCTATCCCACTT
GCTATTGGAGCTTTTTTATGCGCAACAGCGCAGAGTGTGCAGACGATGATTGTGGGACGTCTCCTCGCAGGAATTGGAATTGGAATCTCATCAG
CCATTGTACCACTTTACATATCAGAGATATCACCAACTGAAATCCGTGGAGCACTCGGATCAGTGAACCAGTTGTTCATTTGTATCGGAATACT
TGCTGCCTTGATAGCTGGTTTACCCCTTGCAGCAAACCCTCTTTGGTGGAGGACGATGTTTGGTGTTGCGGTTATCCCTTCCGTTTTATTAGCC
ATAGGAATGGCTTTTTCTCCAGAAAGCCCAAGGTGGCTCGTTCAGCAAGGAAAACTTACTCAAGCCGAAAAGGCTATCAAAACTCTTTATGGTA
AAGAAAAAGTGGTTGAATTAGTTCGTGACTTGTCAACCTCTGGCCAAGGTACTTCTGAGCCAGAAGCAGGATGGTTTGATCTATTCAGCAGCCG
CTACTGGAAAGTTGTAAGCGTAGGTGCGGCGCTCTTCTTGTTTCAACAGTTAGCTGGAATAAATGCAGTTGTGTACTACTCTACATCTGTGTTC
CGCAGCGCCGGAATCCAATCTGATGTTGCAGCCAGTGCTCTTGTTGGAGCATCAAACGTGTTTGGAACTGCTGTTGCTTCGTCGTTGATGGACA
AAATGGGAAGGAAAAGTCTTCTACTTACTAGCTTTGGTGGAATGGCGTTGTCGATGCTGTTGCTCTCTTTGTCCTTCACATGGAAAGCTCTAGC
TGCATATTCAGGCACTCTCGCTGTTGTTGGAACTGTTCTATATGTCCTGTCATTCTCACTTGGTGCTGGCCCAGTACCAGCTCTTCTTCTTCCA
GAGATATTCGCATCCCGTATCAGAGCAAAAGCCGTTGCTCTTTCTCTCGGCATGCACTGGATCTCAAACTTTGTGATTGGACTCTACTTCTTAA
GTGTTGTGACTAAATTCGGAATCAGCAGTGTCTACTTGGGTTTCGCGGGAGTGTGTGTCCTTGCGGTCATGTACATCGCAGGAAACGTGGTGGA
GACTAAAGGACGATCGCTCGAGGAAATAGAGCTTGCTCTTACCTCTGGTGTTTGAAATTAAACAAAAAGAATATCAATACCACTTTGTTTCATC
CTGTATTCCTGTTAGTCTCTATCTCTCTTTCGGTCAACTCTTCTTGTTCTTTAATAACTTGTGCAATGGACTAAGTAATCAATCGATAACGAGA
AATCGGTTCATTCAG |
Primers for UN18278 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
AAAGCTCTCTCTCAGTGTCCTCTC |
59.841 |
24 |
GCGTTTCCTTTAACTGCTGC |
60.025 |
20 |
149 |
8 |
156 |
| 2 |
AAAGCTCTCTCTCAGTGTCCTCTC |
59.841 |
24 |
GGCGTTTCCTTTAACTGCTG |
59.883 |
20 |
150 |
8 |
157 |
| 3 |
AAAGCTCTCTCTCAGTGTCCTCTC |
59.841 |
24 |
TAGCTCCCATGATGGCTTTC |
60.177 |
20 |
268 |
8 |
275 |
|
|
