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Simple sequence repeat (SSR)
>UN00201
GGGGAGGCGATGACGTTCCAGTTCCGTAACGGGGGCGTTGTGATTTCTTCGACTTTAATCTCATTGTCTTTAATCCCACTAAATCGAACGCCCA
CTACGATCTCTTCGGTTGATTTGTTCAGTCGGCGATCTCATGTATAAATAGACGGCACGGATGGACAAATTAAACCCGCTTGAGATCATAAGTC
TGATTCAGACGGCGTGGATGGAGATCTTCAAGGGCCTCAGAGACACAAAGGTTAACATATTAAATCGGTTTTGTTGGTATGTTATCCCAGAATC
GGCTCTGTTTTCGAGTACTGACAGTATCACTTTCATTACAGGGGAGTCAGTGTATTCTTGAAGAATATATTTTGAACAACTCTACTCCCTCTTT
TCTTATTGTTTTCCATTAGCTACTATGATGAAAACCATCATCTGTCCGCTAACACATTTGTCGACGTTTCTGTTTATATATTTCAGACATTATC
TATTTCAAAGGTTCAATTGATCCATATGATATATATATATATTGTACTACCATATGCATACTGAAAACAGACATAAAGAAAGAGAAACATCATG
GTTAACTTGAATATTGACAGGTGTGTTACATAAGAAGCACTATATATACGTTAATCAGTAGAAGTTTAGTTATGTATGTGAATGATTGTTTGTT
CACTTTTTTCACACAGGAGTGTGACAACGTTTAGCGTGAGTGTTATCCAACTTGAAACTGCACTTTGTTTTATCATGTGTATGTCATACATGGT
TTGTGATGCTGTTGGAGAATACAAAATCAATTTTTGTATTCAGTGATTCTGATATGTTTTTGTAGGTATGGTGCAAAGACAGCAGAGGCGACAA
ATAGACAAACGCGGGGTTTGGAGCAGCAGGGCATGCTCTTAGAACAGCGTGGACAGTTTTCATGATCAGACAAGCTCTCCCAAAGAGTCTGGAA
TAAAGAGTGTGTTTAATTGATGTCTAAAACCGCAGTTAAAATGGCAGCCTAATAAAAAAAAGGGAAAGGAGTTTTTTTAAATCAACCGAGAAAA
AGAGTTATAAGTGGATGCTGTGTTGTTTGTACATCAGTTTCATTGCCTTGGTGCAAAAGCAATAGTCATTTT |
Primers for UN00201 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GTCCGCTAACACATTTGTCG |
59.199 |
20 |
TCACGCTAAACGTTGTCACAC |
59.82 |
21 |
278 |
420 |
697 |
| 2 |
GTCCGCTAACACATTTGTCG |
59.199 |
20 |
CGCTAAACGTTGTCACACTCC |
60.736 |
21 |
275 |
420 |
694 |
| 3 |
GTCCGCTAACACATTTGTCG |
59.199 |
20 |
CACGCTAAACGTTGTCACACT |
58.914 |
21 |
277 |
420 |
696 |
|
|
