 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN19584
GAGAGAGATAGAGAGCGGTGAGCTTGCGTAGGAGATAACGTCTCTTTTCCCGTCGTCGGAGACGGAGGTTATGCCTCTTGGCTGTTTAGGTTAA
TATTAAGCTTTCATTTCTAAGTGCTTTTTGAGATATGGAACAAGGTCACATCTGCTCAGGCTGCTACCTGTTTCGGGTTTCTTCGTTGCAAGAA
GCACTCGATTTACGGTTTCTTGCCCTCTCAGGCTTCCTTGGTGGCTCTTTCGTCAACTGCACTTAGTGGGCTTCATGTCTGCAAGTTATCCTTT
CTTGGCATAGTCCTGAAGGCTCATCTAAACCTGTCCTTACCTTAAAATAAACTGTGCAAGTTCCTATTCCATGTCCGGTTCTTGTGGGTGACTA
AACGAAGGATGTACAAGCTTCTTTTCAAGTTTTGACATGTCGTAGCTTTGATAGTCTTTTCCTAGTAGAGTCTCTGAACCCCCTTGAGTGAAGC
GTTGGTTCCTTACCCAGATAACGTTCCTTCTTGTTGGTTCATTGCGTCTTCCAGTCCTCGATATGTTTTGCCTTCTTCTCTTGGTGTCTTTCTT
TTTCTTTGCTGGTCAACCGATTGATTTTCAAAGTAAATAAAGGCCGGCTTACCTAGCGGGAGTAACTCTTGAGTTTGCTACTATAAGAACAACT
GGAAACTGAAGTTATATACATTACATAAAAAAAATACTAAAGGAGATACTTTACTTTACTGTTGGAGGGATGGAGAGGTATAATTTAATCAAAG
AAGTTGGTGATGGAACTTTTGGGAATGTTTGGCGAGCTGTCAATAAACAGACGGGTGAAGTCGTTGCAATTAAAAAAATGAAGAAGAAGTATTT
CTCTTGGGAAGAGTGTATTAATCTGAGGGAAGTGAAGTCGCTTAGCAGAATGAATCATCCAAACATTGTGAAGCTGAAGGAAGTCATTCGGGAG
AATGATATCCTATACTTTGTGTTCGAGTATATGGAGTGCAATCTTTACCAGCTTATGAAGGATCGTCCTCAGCTTTTTGCGGAATCTGATGTCA
GAAATTGGTGCTTTCAAGTCTTTCAAGGCCTTTCTTACATGCATCAGCGTGGATACTTCCACCGTGATCTAAAGCCAGAAAATCTATTAGTCTC
TAAAGATGTCATTAAGATTGCTGATCTTGGCCTAGCCCGGGAGATTGATTCGAGTCCACCTTATACAGAGTATGTCTCGACACGCTGGTACAGG
GCACCTGAAGTACTACTACAGTCATATGTGTACACGTCAAAAGTTGATATGTGGGCGATGGGCGCTATTCTGGCTGAGCTGTTGTCTCTTCGTC
CTCTCTTTCCTGGAGCTAGTGAAGCAGATGAGATCTATAAAATCTGCAGTGTGATAGGTAGCCCAACTGAAGAGACATGGTTGGAGGGGCTTAA
TCTTGCTAGCGTTATCAGTTACCAATTCCCTCAGCTTCCCGGTGTACACCTTTCAAGCTTGATGCCGTATGCTAGTGCAGAGGCTGTTAGCCTT
GTTAAGCGTCTCTGCTCATGGGATCCCTGTGATAGGCCAACTGCTGCAGAGGCTTTGCAGCATCCGTTCTTCCAGAGTTGCTACTATGTTCCAC
CATCTCTCCGTGCCAAACTGTCTGTTGGACAGAGAGGGTCTCTCGATCATCAGCAGCAGTCCGTTAAGAGGTTGCCGGTAACTTTGACCAGTAC
TGCTAGTAATAATAATAATAAGGCGGTCAACAGCTATGCTACTCCAAAGGCGAATGCTCCTCCTTACGGTGCTTATCAGACCCAGCGGAAGCAG
GAGATGTCTAATAAAATTAATCAGGACACAGCATGGTACAACAAGCCTGTGGGAAGTTATCATGTCAGAGATGCTAATAAGTATATACCACCAC
CTGGAAGGAAGAGTCCTCCATCTAAGAACAAGAACTGGGTATTTCCTCGTGGGCCATCAGAGAATGCAAATGCAGCGGTGGGAGGAGGAAGATG
GAGTCAAAGGCAGACACAACAACAACCGGCGATGAAGGCAGGGTGGGTGGGAGAAAGTGGTGACATGTTCCTGAGACCTACACAGCCTCCCAAT
CCCTACTCTAGAAGAATCGCTGGTTAATGGCCAAAGGGTCTTTCCTTATGACCCACACTCATCATCATCTACTATTACCGGAGTCCAAGTCGAA
AGTATGAAAGACTGTTGATTTACCTCTTATTTGTGTGTTTCTCCTTTCCTAAACTACCTTGTTTATCTATGGATTCTTCGTCGTTCTGTTCTTG
ACTTTTTGAATTTTAAGCGTCGGATGTATGGAGTTTTCTTTTCATTTCGCAATAAAGCTCTCGACTTTTGGACC |
Primers for UN19584 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TCCGTTCTTCCAGAGTTGCT |
59.989 |
20 |
CGCCTTTGGAGTAGCATAGC |
60.003 |
20 |
178 |
1567 |
1744 |
| 2 |
TCCGTTCTTCCAGAGTTGCT |
59.989 |
20 |
CTGGGTCTGATAAGCACCGT |
60.134 |
20 |
211 |
1567 |
1777 |
| 3 |
GAGGTTGCCGGTAACTTTGA |
60.11 |
20 |
CTTCCTTCCAGGTGGTGGTA |
59.959 |
20 |
226 |
1666 |
1891 |
|
|
