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Simple sequence repeat (SSR)
>UN20420
GGACCCTCCAAAAGACCTACACAAGAGTACACAAAGCCACACACATCCTTAGGCGATAATCTAATAACAGAAAACCCCCCAAAAAGAGAGAGAG
AGTGCTTCTTCATGTACTCGTCTCAAAACGATGGCGTATACCAACCGCTTCTCCACCCTCCGGCTGATGGAAGGGTGCCGCTTTCTCCATCGAC
GGAGTCTAGCAACGGCGAGCTAGAGAGAGTGCTTTCCGACGTTGAAATTCCGTTATTTCACCGCCTTCGTAAGGCCACGATGATTGAATCCAAG
CTTCTCTTCAAACTTGCTGCTCCTGCGGTCATCGTGTACATGATAAACTACCTGATGTCCATGTCCACTCAAATCTTCTCCGGCCATCTCGGGA
ACCTAGAACTCGCTGCAGCTTCTCTTGGTAACACCGGGATACAAATCTTCGCATACGGTCTCATGTTAGGAATGGGTAGTGCGGTAGAAACGTT
GTGTGGTCAAGCGTTTGGAGGTAGAAAATACGAGATGCTTGGCATATATCTCCAGAGATCCACCGTGCTACTCTCTCTCACGGGGGTTCTCCTA
ACGTTAATCTACGTCTTCTCCAAACCCATTTTGCTTTTCCTAGGAGAGTCGCCGGAGATAGCTTCCGCCGCGTCTATCTTCGTCTACGGCCTAA
TACCTCAAATCTTTGCCTATGCCGTGAACTTCCCGATCCAAAAGTTCCTACAGTCGCAAAGCATCGTTGCTCCGAGTGCTTACATCTCAACGGC
CACGCTCTTCGTTCACCTTCTCTTAAGCTGGCTCGCTATTTACAAGCTTGGCATGGGGCTTCTTGGAGCCTCGCTTGTGCTCAGCCTCTCGTGG
TGGATTATAGTGGTGGCTCAGTTTGTTTACATTGTGACGAGTGAACGGTGTCGTGAGACGTGGAGAGGGTTTAGTGTGCAAGCGTTCTCGGGGT
TACCGAGTTTCTTTAAACTCTCTGCTGCCTCTGCCGTGATGCTCTGCCTTGAGACTTGGTATTTTCAGATTCTCGTGCTTCTCGCCGGACTTCT
CGAGAATCCAGAGCTTGCTCTTGATTCTCTCTCGATTTGCATGACGATTTCAGGATGGGTGTTCATGATATCTGTTGGATTCAATGCAGCGATA
AGTGTAAGAGTGAGCAATGAACTTGGAGCTGGAAACCCTAAATCAGCATCGTTTTCTGTTATCATCGTCAACATTTATTCGTTAATCACATGTG
TGATCTTAGCCATTGTGATTTTGGCATTTCGTGACGTCTTGAGCTATGCTTTCACCGAGGGTGAAGAAGTTTCGGCCGCTGTTTCTGATCTTTG
TCCGCTTCTTGCCTTAACTCTTGTCCTCAATGGAATCCAACCTGTCCTTTCCGGTGTGGCGGTTGGATGCGGTTGGCAAACGTTTGTGGCAAAA
GTTAACGTTGGATGTTACTACATTATCGGAATTCCTCTTGGGGCTCTCTTTGGGTTTTACTTTAAGTTCGATGCCAAGGGTATATGGACGGGAA
TGATATGTGGAACTCTTATACAAACGGTTATTTTAGCATGGGTCACGTTTCGTACAGACTGGACAAAAGAAGTGGAAGAGGCTTCTAAAAGGTT
GGACAAATGGAGCAACAAGAAACTAGAAGTGGTTCCCGAATGAACAGATTGGATAACCGGTTCAAATGCTCAAGTTAACCGGTGAGCTGGTATA
ATAGGACATGGATATTATCCCTCAGACCTCAATTCGATATAAGCTTTCATTAATTTATGTGCTTGCTTAAAATAAATAACAATTAGGTGATGTA
TCTTGTATGTCAAATTACAATGTTAATTGCTTTCCTATTAATGATTCAACCTATGGTTAGCAGG |
Primers for UN20420 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
AGCCACACACATCCTTAGGC |
60.142 |
20 |
CACTCTCTCTAGCTCGCCGT |
59.914 |
20 |
185 |
35 |
219 |
| 2 |
AGCCACACACATCCTTAGGC |
60.142 |
20 |
GATTCAATCATCGTGGCCTT |
59.9 |
20 |
244 |
35 |
278 |
| 3 |
AGCCACACACATCCTTAGGC |
60.142 |
20 |
ATTTCAACGTCGGAAAGCAC |
60.118 |
20 |
202 |
35 |
236 |
|
|
