Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN21401
GGGAGGCGAATGCGAGACGGAGTGGTACACAACCTTGTTCCTTCCTTGGAAAAGAGAAGATAAGAGCTTCTTCTTCTTCTTCCTGGTCGTTTAA
GAAAAAGAAGTCTCTCTCCTTCCCTTTTTTGATCTCTGAAAAAAGAATCTGTCTTTGCAATGGATCAGATGTTCAACAAGGTTGGATCCTACTG
GTTAGGTCATAAGGCGAACAAGCAGTTTGACTCTGTTGGTGACGATATCAACTCGATATCAACGAGCATCGAAGGAGGAACAAAATGGTTGGTC
AACAAAATCAAAGGAACAATGCAGAAGCCGTTGCCTGAGCTGCTGAAAGAATATGATTTGCCTGTGGGTATCTTCCCACGGGATGCTACAAACT
ACGAGTTCGATGAACAGACCAAGAAACTGACGGTGCTGATCCCATCTGTCTGCGAAGTTGGCTACAAGGACTCATCCGTCCTCAAATTCACCAC
AACAGTAACGGGATATCTCGAGAAAGGGAAGCTATGTGACGTGGAAGGGATGAAGACAAAAGTGATGATATGGGTCAAAGTCACAAGCATCTCT
GCGGACTCATCAAAGGTGTATTTCACTGCGGGGATGAAGAAGAGCAGAAACCGAGATGCTTATGAGGTTCTAAGAGATGGCGTTCGAGTTGATA
AATTCTAACTCCTTCTGCTGATGAGAGTATACATATATATATTCTCATCTGTTATCAATTAAATTATTAAGTTTTAAGCTTTTTATGGGTTTGC
ATGATGGTGTTATGATCTGAAGAATTAACTTGTGCTGTATGGATTCGATTGATGAAGAGTATTCTTGGTTTTGTAT

Primers for UN21401 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 CGAGACGGAGTGGTACACAA 59.745 20 TTTGTTCCTCCTTCGATGCT 59.813 20 260 13 272
2 CGAGACGGAGTGGTACACAA 59.745 20 CTCCTTCGATGCTCGTTGAT 60.362 20 253 13 265
3 CAACCTTGTTCCTTCCTTGG 59.563 20 TTTGTTCCTCCTTCGATGCT 59.813 20 243 30 272