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Simple sequence repeat (SSR)
>UN22706
CTCTTTTCGTTCCTATTGATTTCTTTATTTATATGTATTCTAAAAAATTTGTTTTTACGTTAGGCTAATTCTAATGATTCTAGTGTTTTTTTAT
TTATTTTGTTGTACAAAAAAACTTTTTGAATTACCTGTTGAAAGCGATTTCCCTAAAGAAATCGCTTTCAACGATGTCCAATATCCCTTCCTTT
TCCAAATTTTTTTACGAATACGCTTTTTCGAGATAGAAGTACGTTTTTTTGGAACTGCCATTCAAAAATGAAAAAAGTTTTTCAGTGGTATAAT
TGTATGTCAAAGACATTTATTATTCTATTCTTTCGTACTCCATATCGAGTAATTTTTTTCTTTCAAATTTTATTATATATTATTTTTCAAACAA
AACAGACATTCAAAAATTTAAAACCCAACTATTTTTTACCTTTTTCTTGAAAAATTTTTTGTATTTAACGTTTTAAATCCGTATGAGAGTGCTC
ATTTAATTAATCTATACTGTATAGATTATATTAGAAAAAATTTTATTAAATTTCTTCACTTCATATGTAAAAAAAAAAATATCGATTATAATAC
TATTTCTTGAAAAAAAAAGCTCATTTAGTGTACTGGAAGACAATCACTAAATTCCATAATTCAATAATAATTCTAAATAATCAAACCCAAATAA
CTTTTTTTTATAATTAATATTAAGTATTTTTTTGTCGTGTAAATCTTTGTTCTATTCTTAATATATGTATATAAATTATTGTAATACGGAATTA
TAATTCACTTTTTTTCTGTATCTGCATAAAATCACAATTTTATTTAGTAGTAAAAAAAAAAAAGACAAATCGTTTTTTTACAGTAACTTAGTAA
TATTATTTAATAACTTCTAATTTTTTGATTTGAATATATATTTCTTTTCAATCAAAGGTTTATGAAGGATTATACTAATTCGAAAAAATTTCTA
TTTAAGTTTGAAATAATGCGCTTTTTTATTATCCCCTTTGAAAAAAATATATATATATACAAACCAGTGAATAAGAAATAATAAATTTAAGAAT
AAAATAAAAAGGGTTTTTTATTTTATGGAACATACATATCAATATTCATGGATCATCCCTTTCATTCCACTCCCAGTACCTATTTTACTCGGAG
CTGGACTTCTACTTTTTCCGACAGCAACAAAAAACCTTCGACGTATGTGGACGTTTCTGAGTATTTTTTTGTTAAGTATAGTTATGATCTTTTC
GCTCTATCTATCTATTCAACAAATTTTTATAAGTTGCATTCATCAAAATGTATGGTCTTGGACCATAAATAATGAATTTTCTTTTGAGTTCGGT
TACTTTATTGATCCACTTACTTCTATTATGTCAATATTAATTACAACTGTTGGAATTTTGGTTCC |
Primers for UN22706 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTTCAATCAAAGGTTTATGAAGGA |
59.067 |
24 |
GGGAGTGGAATGAAAGGGAT |
60.133 |
20 |
217 |
892 |
1108 |
| 2 |
TTCAATCAAAGGTTTATGAAGGA |
57.811 |
23 |
GGGAGTGGAATGAAAGGGAT |
60.133 |
20 |
216 |
893 |
1108 |
| 3 |
TTTTCAATCAAAGGTTTATGAAGGA |
60.21 |
25 |
GGGAGTGGAATGAAAGGGAT |
60.133 |
20 |
218 |
891 |
1108 |
|
|
