 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN22819
GGTCTCTCGTTCATGATTCAAATCTGTCTCTAGGGTTTCCAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTCTAGCAAAAATGGCGATGGCCATGGCTC
TTCGAAGACTTTCTTCTTCAGTTGACAAACCCATTCGTCCTCTTATCAGATCAACTTCATGCTTCATGTCATCTCTGCCTAGTGAAGCTGTGGA
TGACAAGGAGAGATCTCGTGTCACTTGGCCAAAACAGCTTAACGCATCATTGGAGGAGGTTGATCCTGAGATTGCTGACATCATTGAGCTTGAG
AAAGCTAGACAATGGAAGGGACTTGAACTCATTCCATCTGAGAATTTCACATCTGTCTCGGTGATGCAAGCTGTTGGCTCTGTGATGACTAACA
AGTACAGTGAAGGGTACCCTGGCGCTAGATACTATGGAGGAAACGAGTACATAGACATGGCTGAAACTTTATGCCAAAAGCGTGCTCTTGAAGC
TTTCCGGTTAGACCCTGAAAAGTGGGGAGTGAATGTTCAACCTCTGTCTGGATCTCCTGCTAACTTCCATGTCTACACTGCATTGCTAAAGCCT
CATGAGAGAATCATGGCTCTTGATCTTCCTCATGGTGGTCATCTTTCTCATGGTTATCAGACTGACACCAAGAAGATATCTGCTGTGTCTATCT
TCTTTGAAACAATGCCTTATCGATTGGATGAGAGCACTGGCTACATCGACTATGATCAGATGGAGAAAAGTGCTACTCTTTTCAGGCCAAAACT
AATTGTTGCTGGTGCAAGTGCTTATGCTCGGTTGTATGACTATGCCCGCATCCGAAAGGTGTGTAACAAGCAAAAAGCTGTGATGCTAGCAGAT
ATGGCACACATCAGTGGTTTGGTTGCTGCTGGTGTAATCCCTTCACCTTTCGACTATGCAGATGTTGTAACCACTACAACTCACAAGTCACTTC
GTGGACCCCGTGGAGCCATGATTTTCTACAGAAAGGGTGTTAAGGAAGTTAACAAACAAGGGAAAGAGGTTTTGTATGATTTTGAAGACAAGAT
CAACCAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGGTGGTCCACACAACCACACTATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTCAGAG
TACAAAGCATATCAAGAGCAAGTCTTGAGTAACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCTGATGGAGAAAGGGTATGAGCTTGTTTCTGGTGGAACTG
ACAACCATCTGGTTCTAGTGAATCTGAAGCCCAAGGGAATTGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTTCACATTGCATCAAACAA
AAACACTGTTCCTGGAGATGTTTCTGCCATGGTTCCTGGTGGAATCAGAATGGGTACACCTGCACTCACTTCCAGAGGCTTTGTTGAGGAAGAC
TTTGCTAAAGTTGCTGAATACTTTGACAAAGCTGTGAAGTTGGCTCTCAAAGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACCAAGCTGAAAGACTTTGTGT
CAGCAATGGAAGCTTCTTCAACCATTCAATCAGAGATTACCAAGCTGCGCCATGAAGTTGAGGAATTTGCTAAACAGTTCCCAACAATTGGGTT
CGAGAAAGAAACCATGAAGTACAAGAACTAATAAATGTCTTCTCATGCAAGTCTTTTACTATGCTTTGAACTTCCATGGAATGTATAGATGATA
TGATACATGTGCTCTATCTTATGCTATGAGAAAAAAATAATGAACGTTCTATGCAAA |
Primers for UN22819 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GGTCTCTCGTTCATGATTCAAA |
59.174 |
22 |
GGCAGAGATGACATGAAGCA |
59.95 |
20 |
173 |
1 |
173 |
| 2 |
GGTCTCTCGTTCATGATTCAAA |
59.174 |
22 |
GGATCAACCTCCTCCAATGA |
59.862 |
20 |
254 |
1 |
254 |
| 3 |
GGTCTCTCGTTCATGATTCAAA |
59.174 |
22 |
TCCAATGATGCGTTAAGCTG |
59.833 |
20 |
242 |
1 |
242 |
|
|
