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Simple sequence repeat (SSR)
>UN23562
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GCACGAAAGGCGTAACGATCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAATAGACATGTCTGTGAAGATGCGGACTACCTGCACCTGGACAG
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GGCCCGAGCCATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTGTGTCAGTACCTACGGGCCAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAG
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GGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCATTAAAGCGGTACGTGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCATATCCG
GTGTGGGCGTTAGAGCATTGAGAGGACCTTTCCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCACCTCTGGTGTACCAGTTATCGTGCCCACGGTAA
ACGCTGGGTAGCCAAGTGCGGAGCGGATAACTGCTGAAAGCATCTAAGTAGTAAGCCCACCCCAAGATGAGTGCTCTCCTATTCCGACTTCCCC
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TTTCTTTGGCCCAATTTTCGATTAGAAGATTTAGCTTGTATGAATCGCTATTGGTTTAATACGACTAACGGAAATCATTTCAGTATGATAAGAA
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AAATATATAATATAAGTTACGGTATATGAAAACAATTGGATGCACAAACGTGAGGTATTGCTTTAAATTAAATCTTTATACATGAGATTCATTG
AATTAATGATATAGATACCACTCAGAGCGGATCCATAAATAAATTTTTAAAATCTTCCTTTTTTAGATCGAAATTAAAACTTTTAATTTATAAA
ATTAAGAATTAAGAAGTTGATAATTAAATTCGGATCCTTGTACAAAAAAACTACCATTATTATTACTGATCAGTAAAATTCATATCTTTCAATT
CATATTAAAAAGGGAAGGATTTCTTTTTATGATAAAAAATACATTCATTTCATTTCAAGAAAAAAAAGAAGAAAGCAAGGGATCTGTTGAATTT
CAAGTATTCAGTTTCACTAATAAGATACGAAGACTTACTTCACATTTGGAATTACACAGAAAAGATTATTTATCTCAGAGAGGTTTACGAAAAA
TTCTGGGAAAACGCCAACGACTGCTGGCTTATTTGTCAAAAAAAATAGAGTACGTTATAAAGAATTAATTAATCAGTTGAATATTCGGGAATTA
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TTCTTCGCTTAATTGTTACTCTAGACGGTGAGGATGTTGTTGATTGTGAACCCATATTGGGTTATTTACACAGAGGAATGGAAAAAATTGCAGA
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TATGAGAATGATGCATAATTTTTTTCGTATTGGAGGAATAGCGGCGGATTTACCTTATGGTTGGGTAGATAAATGCTTGGATTTTTGTGATTAT
TTTTTAACAGAGGTTGTTGAATATCAAAAACTTATTACACGAAATCCTATTTTTTTAGAACGAGTTGAAGGCGTTGGGATTATTGGTGGGGAAG
AAGCAATAAATTGGGGTTTATCCGGACCAATGTTACGCGCATCCGGAATACCATGGGATCTTCGTAAAGTTGATCGTTATGAGTCTTACGATGA
ATTTGAATGGGAAATTCAGTGGCAAAAACAAGGAGATTCATTAGCTCGTTATTTAGTACGACTTAGCGAAATGACAGAATCCATCAAAATTATT
CAACAGGCTCTGGAAGGACTTCCGGGGGGTCCCTATGAAAATTTAGAAAGTAGAGGCTTTGATAAAAAAAGGAATCCAGAGTGGAATGATTTTG
AATATCGATTCATTAGTAAAAAACCTTCCCCTACTTTTGAATTATCGAAACAAGAACTTTATGTAAGAGTTGAAGCTCCAAAAGGGGAATTGGG
AATTTTTCTAATAGGAGATCAAAGTGGTTTTCCTTGGAGATGGAAAATCCGACCACCAGGTTTTATTAATTTGCAAATTCTTCCTTAACTAGTT
AAAAGAATGAAATTGGCTGATATTATGACGATACTCGGTAGCATAGATATAATTATGGGAGAAGTTGATCGTTAAAATGATAATTTATGCAACA
GAAGTACAAACTATAAATTCTTTTGTTAGATTGGAATCTTTAAAAGAGGTCTATGGACTCATATGGATATTTGTCCCTATATTTTCTCTTGTAT
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GTTGAGGCACAATCAAAATATGGTTTTTGGGGATGGAATTTGTGGCGTCAACCTATAGGTTTTATCATTTTTCTAATTTCTTCCCTAGCAGAAT
GCGAGAGGTTACCTTTTGATTTACCAGAAGCGGAAGAAGAATTAATAGCAGGTTATCAAACTGAATATTCCGGTATCAAATTTGGTTTATTTTA
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CTGGAGCTATTTGAAAAGGATCAAATTTTTGGAACAACAATTGGTATCTTTATTACATTAGCTAAAACTTATTTGTTCTTGTTCATTTCTATCG
CAACCAGATGGACTTTACCTAGGCTAAGAATGGATCAACTATTAAATCTTGGATGGAAATTTCTTTTACCGATTTCCCTTGGTAATCTATTATT
AACAACTTCTTTCCAACTCTTTTCACTCTAAATTGAAAATCAATCCAAGATATTCATTACTTGTTTTAAACAAGAGAAAGAAACAAAGATCAAA
TTATTCATAGATAATTACAATATGCTTCCTATGATAACCGGGTTCATGAATTATGGTCAACAAACCCTACGAGCTGCAAGGTATATTGGTCAGG
TTTCATGATTACCTTATCCCACACAAATCGTTTACTGTACTATTCATACCCCTATGAAAATAATAACATCAGACGTTTCCGCGGTCGATCATTT
CGAATTGATAGTGCATGCTTGTGAGTATGTGTCGAGTATGTCTATAGATCTGCCGTGTGATG |
Primers for UN23562 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
TTGGCCCAATTTTCGATTAG |
59.901 |
20 |
TACCTCACGTTTGTGCATCC |
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20 |
240 |
14388 |
14627 |
2 |
TTGGCCCAATTTTCGATTAG |
59.901 |
20 |
CTCACGTTTGTGCATCCAAT |
59.572 |
20 |
237 |
14388 |
14624 |
3 |
TTGGCCCAATTTTCGATTAG |
59.901 |
20 |
CGTTTGTGCATCCAATTGTT |
59.444 |
20 |
233 |
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