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Simple sequence repeat (SSR)
>UN24488
GGCAAAACGGAATAAAAAAGTTGAATGCAGATGTTTTAATCAATGGTTGTTGTGAAATGTTGAGGCTGTAAATTGTAATGGCTGCTTTTCAAAC
CCCCTTTGGCTTCTCTCCTTCTAAATATTGTGTAGAGCTGATTGAGAAGCATACTTTATAAAGAACTATGTAATCTCTTATAATCTGAATAATA
TAGACTATATTTTCCAATTTCGACGCACATTGAAGAGTTCATTCACTAACGTAGTTCGGATTTTAGAAGAGTAACTACAAGAAAGAAAAAAAAT
CTTCTCTTGTTTCCAATTTCCATCATAGTTTTTAGCACAAAACATATAAATGTTAGTGTTTGTATTCTAACACGTCGTTCTATACCATCATAGT
TTTTAGCATAAAACACAATAAATGCTAGTTTTAGATGGTTGTAGATTGCAAACTACGTACGTCGATATTTAGGGATAACATATTGATAGACATT
TTTGTACTTGTACCATTTTTTATTTCAGTAACATACTTTTTTATAATGTTTTTTTTTTACAAAAAAAGTTACTCTTTTTTTTGGGCTGCACCTC
TCATCTAATCCTCGTGTGAGAGGTGTAACCCACGGATGAACTCTCTCCCGAATATTCAAATGAGTCATAAACATGGATCCATATCCGTGTGACC
ACATATGAAACTAATAATCTCGCACTAGAAAAGAGTTGAACTCTGGCCTGAACCAACAAAGCACTCTTCTTCTAGTGGAGACCACTAGACCACA
CAATGTGGTTACCTTTTTATAATGTCTCATATATATATATAACAACCATTTTATTAAATCAGATCGTAAACGAAGCATACCACCAACCATGGTG
GTGGAACACTAAAAATAACAGATAAACTTGATAAATCTAAAAGGAGAACTTGGGGAAAAGCTTTAATTCGTCGGTCATGAGTTCGAGTTTTGCC
AAGAATTAAGTTGTCATTGCTTGGCTAGACGAAAATGGGGCTATGGTTTAGGTTTCATTAGAAAACCCGGGGTCAAACTAGTCGCCTGTACTTG
TCCTTCTTGGAAATTATTTGGATCTCGACCGAGATACCTCCATGTTAAACAAAATATAAACATAAAAATGATTTTTAGTCAAATTCATTTTTGA
ATTTTGTTTTTTTTTGAAACTGATTTGCATTTTTTTTGAAATTTTATATGATATCATGCAAAAACCAGTTTAAAGAATACTTATTATAAACCCA
AAATGTATAAATCGACATTTATTGTTACATGGGAGTATTGTTTGAGACATCTATCTTAATAAAATGGAGGGAGTATTGATCTGCTATGTTATTA
GGGTTTAGTGACATTGTTTTGCATTTGACCTCATGTATTTAGTGTTTACATAAGTTAAATTCAGAAATCATGATATTATGTTATAATTATTAAA
ATCACGGAAACATGAAAATTTAAACATAATAATAAAACATTGC |
Primers for UN24488 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GGATCCATATCCGTGTGACC |
60.018 |
20 |
ACCATGGTTGGTGGTATGCT |
60.119 |
20 |
207 |
639 |
845 |
| 2 |
GGATCCATATCCGTGTGACC |
60.018 |
20 |
GGTTGGTGGTATGCTTCGTT |
59.859 |
20 |
202 |
639 |
840 |
| 3 |
GGTGTAACCCACGGATGAAC |
60.096 |
20 |
ACCATGGTTGGTGGTATGCT |
60.119 |
20 |
260 |
586 |
845 |
|
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