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Simple sequence repeat (SSR)
>UN25149
GGCTCTTTTGGGGACCCCGTCGCGCCCCTCGTGAAAAAGATATTATTATTATTATTTTTCTCTTCTTTGTATACCCGTTTTCGATTTAGGGTAC
CCAATCTCTGCGATCAAAATCTCGGCTTTTTGCCGCACCATAAATCTTGTTCCGATTCTCCAATCCATTCCTTCGATTCATCTCCACTGTTCAC
GAATCCAGCAGTGCTATCCTCCCCCTTCTCCTTTTGTACTGATTTAAAGATGGCAGCTAAAGCTAATAATCTTCCCGACAGTGAGGTTGTGCCA
TCAGCTGTTCGGGAGGTTACATCGATTCTTCGCGCGGCTCATGATATACATCCCACCCATCCTCGGATTGCTTACCTATGTGTGTGTGGTGCCG
CTGAGGAGTGTTTAAGCGCTGACCCCTTCCTACGTGGGAACGGTGTTCTCTTGTTTGCGTTTCGTCTTAAACGCTGGACTGAAACCAATGATGA
AACACTTGGGGATGGAAAATTGCGGCCTAGTGATGTACGTGACATCCAGAGTTTCTATCTAGAATATTACCAGAAAAATATCCATGCTTTGTTC
AAGTTTATCGAAGACTACAGACATTTTGAAGGATGGGGCCCAGCGCCCATGCCTCTCTGGCCTACTCCTATGGACGGTTTCAAAGCTCTTAGAA
CTCTCAGTGTCAGGGCTGACAGGGCTGAACTTCTCACATATGCATGTGGAATTGCTCTTCCTCTCTACAAAGTCGTGGAGCATCTTTCTAAAGA
TGAGCAACTGCCTCCTGAGATTTTGGAAGCCCACAATGAAGTGAAACGGCTAGCCGAAATCTTTAGGCCATACATGATTTATCCCAGCGATCCT
TATAGTGATGATCATTTTATTTGGAGAATTCCTCAGATCAGGGCTGTCAAAAACGCACTTCGTGGAAAATTCTACCCTAGTAGTAATACTCAAG
GCGATAACAATTCCGAAAACACAGAGATTATTGGCAATAATCCTGCGGACACGCCTGTGGGGATTAATTGGAGACCGATGATAGAGATAATTAG
TCTTCTATTGATTAGCTTTTTTGTGATATGTTTGTTTCAACTACTAATGTTTTAACTTTTTTTAATAGATTATGTGGAATCATCATAATTTCGA
TCGTTGATTTAAGTTTTTTGCATGTTTTTTGGATTGAGTTAATCTACTCCATGTCACATTAGTCAAAATTGTTTTGATTATCTTTTAATAATCG
AAATAAGATAATTTGTGTTTTAACTT |
Primers for UN25149 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CTCTTTTGGGGACCCCGT |
62.211 |
18 |
CGAAGGAATGGATTGGAGAA |
60.006 |
20 |
167 |
3 |
169 |
| 2 |
CTCTTTTGGGGACCCCGT |
62.211 |
18 |
AACAAGATTTATGGTGCGGC |
59.967 |
20 |
143 |
3 |
145 |
| 3 |
CTCTTTTGGGGACCCCGT |
62.211 |
18 |
GAGAAGGGGGAGGATAGCAC |
60.037 |
20 |
216 |
3 |
218 |
|
|
