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Simple sequence repeat (SSR)
>UN26289
ACTTATATTGATGTTTGTTGATATTAGGAAAATCTAACGAAATCCTCCTAAAGAAAAAATCCCTAAGGTCAAAATGAACCGTTCTTCATGGGAT
ATGAAATACGAATCCTTCTAACATATGTGTTGAACCATATGTACTCAAGCCTCGCGGTACAATATTATTTGGAAAAATATGCCTCTTTCTTGTT
TCTTATCCAGAAGGCATTGACCAAATTAAAGTCGTCATATATCGTTCTGTTACCTTTAGTATTTATGATTTGCCGTGACGATATCTCCTGTTTG
AGACTACCATGTGAACACATGAATGATGAAGCACTAAAAATCTAAAACATATATAGAACTTATTAAAATCCTTGGAAAGCATATATTGGTACTT
CGAATTTTAAATGCACATTGTGGTTGTCAAGTAATTCTGAAACGCTACACAGTACACACTTGTGGAAACTTAGAGTTTATATAATTTATTAATT
ATGACACAGAGAAAAGAAAACGTACACTTTTAACAAACAAAACAGACAAAAACGTACACATGCACATGCAAAGAAATGAGGTGAATATATAATG
ATTAATTCAAAAACGTAGGTACCTGGTAATAAGGGCCAAAGTATTTCTTGTAGTCATTGAAAGTTCAGATATAACCTTCTTCACCTTCTCTATC
TCCGCATTCATTTTGTCCTTGAACTTGTCCATACACGTGGTCATCTCTGTCGGCGCCGAGCTTGTCCACGTTTCCAACTTCCTTTTAATCTCCG
CTATTGTGATATTTTCCCTGTTCATGATCACGGCGATCACTTGCTTGAGCTCGTCGGCGGTATCCTTCGTCTCCTTCAGGCAGTCCTTGAAGAT
ATTCGAAACCTGAGGGCTGGTCCGGCTGGAGGCGACCTTTTTGAGAAGGTTAGAGACGATGGACGAGGCACTTTTCGCGGATTTGAGGTTGACG
CTGAGCGATGTTAGGCAGAGTTTGATGGGGTCGGATTTGACGGTTGAAGAGTAGGATGACAATGCGTTGTAGCACATTGTAGGGTATGCTGTTG
AGTCGCATGCGGTTTGAACGAATGTTTTGTCGTTTGGGGCTATGCCTGGTGGGGTTGCTGTTGTTCTCGGGATGTTTGATGAGTTGATGAGGGC
AATGAGAGCTAGGGAGAGTAACACGAAACGCAACATGTTTGTTAATTAGGGATTTCTTTTTTTTCTTAACCTGGGGTTTGGGACAGAATAGAAA
TGCAAACTATTTGACGAATTCTGAAATTATGGAGTATGTATATATATATATATATTAATCTCATAGGATGGATTATTAGTTGTATCTAAATTAT
TAAGGGAATGATTGGATCTC |
Primers for UN26289 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GCTGTTGTTCTCGGGATGTT |
60.119 |
20 |
GAGATCCAATCATTCCCTTAATAAT |
57.991 |
25 |
246 |
1091 |
1336 |
| 2 |
GTTGCTGTTGTTCTCGGGAT |
60.119 |
20 |
GAGATCCAATCATTCCCTTAATAAT |
57.991 |
25 |
249 |
1088 |
1336 |
| 3 |
GCTGTTGTTCTCGGGATGTT |
60.119 |
20 |
GATCCAATCATTCCCTTAATAATTT |
57.931 |
25 |
244 |
1091 |
1334 |
|
|
